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把CDS批量翻译为蛋白序列

已有 17718 次阅读 2014-3-20 22:06 |个人分类:Bioinformatics|系统分类:科研笔记| Protein, Translate, cds2prot

batch translate nucleotide to protein

该脚本用于把fasta格式的CDS按标准密码子表翻译为蛋白质序列，使用方法为（电脑要安装perl）：

perl cds2prot.pl cds_file.fasta > protein.fasta

perl cds2prot.pl cds_file1.fasta cds_file2.fasta cds_file3.fasta > protein.fasta

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