1黄瓜胎萌基因的克隆

2黄瓜种子活力的研究、高活力种子的生产/种子耐储性的研究

3叶片大小基因的分子标记和克隆

4.黄瓜氮素吸收相关基因的克隆/水分养分高效利用品种的筛选培育/钾对黄瓜产量和品质形成的影响：生理和分子机制

5.黄瓜耐盐和耐热相关基因的克隆

6. 黄瓜白粉病/霜霉病/枯萎病抗性相关分子标记筛选

7.嫁接对黄瓜矿质营养吸收的影响

8黄瓜座果性的分子标记：单性结实和丰产性

9. 嫁接对提高黄瓜耐寒性的分子机理

10.黄瓜突变体库的构建：EMS和辐射诱变

11.黄瓜重要农艺性状的群体遗传改良：聚合杂交和轮回选择

12. 黄瓜优良地方品种资源的分子指纹图谱构建和挖掘利用

13. 长货架寿命黄瓜品种的培育/植株、叶片抗衰老的研究

14. NO/H2等气体分子对黄瓜抗性的影响：生理和分子机制

15.SA/BR/JA/ABA/CK/IAA/EA对生长发育的影响

16.钙硼互作对产量和品质的影响

17. 高钙含量的黄瓜/南瓜种子的培育

18.寡糖诱导剂/抗诱剂的开发/诱导抗逆抗病

19. 黄瓜大小孢子培养及遗传转化的研究

20. 黄瓜耐盐、耐热、抗旱、耐阴性的研究

21.真菌菌根/内源共生菌在黄瓜生产上的研究利用

22 嫁接砧木的遗传改良（抗病、抗逆）

23维生素/必需氨基酸/微量元素的合成代谢

24 根系的研究

25 抗蚜虫、根结线虫的研究

26. 黄瓜栽培品种的性状演变和遗传关系研究

27. 黄瓜根系耐低氧的生理遗传机制

28. 黄瓜重要性状遗传群体的构建：心腔大小、果实大小 

29. 黄瓜根系发育的研究

30 激素和逆境/肥水调控对同化物分配的影响（SnRK1,OST1, T6P）蔗糖合成转运

31 黄瓜耐寒/弱光结实的分子机制

32. 糖代谢对黄瓜果实品质和产量的影响

33. 不同施氮水平对黄瓜glutamate/glutamine含量及产量的影响

34. 钙对非生物胁迫的缓解效应