双y轴图形可以使用 plotyy 命令，Matlab Help 给出的例子很清晰的显示出本函数的使用方法：

x = 0:0.01:20;

y1 = 200*exp(-0.05*x).*sin(x);

y2 = 0.8*exp(-0.5*x).*sin(10*x);

[AX,H1,H2] = plotyy(x,y1,x,y2,'plot');

set(get(AX(1),'Ylabel'),'String','Slow Decay')

set(get(AX(2),'Ylabel'),'String','Fast Decay')

set(H1,'LineStyle','--')

set(H2,'LineStyle',':')

本文再补充以下几点：

1、控制y轴的颜色。默认y轴的颜色与数据线的颜色一致。如想换成其他颜色，如下：

set(AX(1),'Ycolor','k')

set(AX(2),'Ycolor','k')

2、分别在不同的y轴下，添加新的图形。如下：

axes(AX(1)); hold on; plot(0:num,az2,'g');

axes(AX(2)); hold on; plot(0:200:19800,flow,'g--');

3、打开以前画的双y轴图，添加新的图形。如下：

open('F:studyavgHeightFlow.fig');

AX= findobj(gcf,'type','axes');    % 获取图层句柄

% 注意AX（2）指左轴，AX（1）指右轴  

axes(AX(2)); hold on; plot(0:num,az1,'r','LineWidth',2);    

axes(AX(1)); hold on; plot(0:200:19800,flow,'r--','LineWidth',2);