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大部分学生都习惯检索和阅读自己比较熟悉领域的文献,这当然很有必要也很重要。不过也要注意了解和自己相关甚至不相关领域的文献,如果觉得这些文献比较有意思,可能希望能更深入阅读。这个时候我们会遇到一些困难和问题。我这里以一篇文献的阅读尝试介绍自己阅读文献的方法,也许能发挥一点启示作用。按照我一般的习惯,我把阅读这类文献分为三个阶段,一是理解背景阶段,二是理解细节阶段,三是联想阶段。下面用一个最近我看的一个文献作为例子说明这个方法。
第一、了解背景阶段,如最近看到一篇关于CPEB的介绍,说是西班牙科学家发现诱发肿瘤的新蛋白质,这里说是一个新蛋白CPEB4可以控制数百个基因的转录。我的印象中,有许多转录因子具有调节大量基因转录的作用,例如比较著名hif就是可以调节数百个基因的表达。但这个分子不是通过转录调节,而是通过调节转录后的mRNA发挥作用。这引起我的兴趣,当然也是因为我缺乏这方面的知识(无知是兴趣的来源)。这个蛋白有4个兄弟,分别为CPEB1(CPEB)、2、3、4,这个文献中是关于CPEB4的研究。这个蛋白到底怎么有什么特殊的作用?原来这个蛋白主要是通过对许多mRNA的poly A来调节蛋白表达的,这确实很有意思。如果你对poly A不太熟悉,可以查查相关资料, 这个poly A很重要,几乎所有的mRNA在翻译后都需要加这个帽子,这个帽子具有调节蛋白表达,影响mRNA稳定性等的作用,而且似乎与DNA上的端粒有点类似,甚至可以说是mRNA水平上的端粒。那么这个作用的重要性就非同小可了。这个阶段就是对文献有个大概了解,因为自己的兴趣主要是这个蛋白,对关于治疗肿瘤的细节就不一定细看了。
第二、了解细节阶段,继续追踪CPEB4或CPEB,发现这个方面的文献很少,例如在medline上,有关文献很少就是一个证据,提示这个分子仍没有受到很大的关注,这里就提示,一个非常重要的分子,研究比较少,可能过去的方法存在问题,也可能被大家忽视。而另一个细节是最近一些重要期刊的相关研究明显增加,例如最近就有Nature上报道,这个分子可以影响miRNA miR-122控制p53表达的稳定性。提示这可能是一个新的研究热点,特别是在肿瘤领域。
简要回顾过去相关文献,会发现CPEB在神经系统中的研究比较多,例如这个基因敲除可以影响海马相关的学习记忆能力,而且这个分子和疯牛病蛋白prion有一定同源序列,也暗示与这个蛋白的功能存在联系。你也会看到早期关于这个分子的一些综述,例如有人提出这个分子是决定细胞存活的重要分子,这时候你会更理解这个分子的重要性:难怪能影响肿瘤的生长,难怪能影响代谢,难怪能影响细胞的寿命或衰老。
第三、联想阶段,每个人阅读文献后的联想会受到个人学术背景的影响,最不幸的是没有联想。我阅读完文献后(大概消耗3小时于收集文献、3小时阅读时间),考虑到这个分子与肿瘤和神经系统的相关性,那么这个分子将可以在抗衰老领域、神经损伤的保护、细胞死亡方式等方面可以开展深入研究。例如,最近关于自噬的研究很热门,那么可以推测,这个分子可能具有促进自噬的作用,可能可通过这个方式增加肿瘤的生存能力。最近关于程序性坏死的研究也很热,那么这个分子可能具有减少程序性坏死的作用。关于抗衰老的研究,端粒的作用很重要,那是在基因水平上,如果是在表达水平上,这个分子也许发挥非常重要的作用,这个方面的研究已经有了,已经不是那么新颖了。
上述三个阶段也不是独立的,你可以在看到一个细节就产生联想。总之,看文献不能只看自己的小范围,也应该随时关注其他进展。在看文献的过程中,要尽量能把握文献的全面信息,把自己感兴趣的细节深入挖掘,在这个基础上要善于敢于联想。上面我只是根据自己的习惯举例说明,其信息的准确性和可靠性可能存在一定问题,不足以作为设计课题的依据。
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GMT+8, 2024-11-24 02:39
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