目前植物的基因/QTL图位克隆,一般是两个步骤:粗定位和精细定位.精细定位的"精细"有两个含义:1 特定区间的高密度标记 2 特定区间足够多的重组.这二者缺一不可.没有标记无法前进,没有重组,再多的标记也没用,因为分子标记和目标基因的距离是通过重组来衡量的.要获得高密度的标记,当然最好是序列已知,这样开发标记比较容易,所以没有全基因组序列的植物精细定位比较困难,标记是限制因素.要增加重组,有两个办法:一是扩大群体,这是主要的方法,二是利用历史的重组,即关联作图的方法.当然关联作图可能还有些问题,不过好处也是显而易见的.