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分子置换的步骤
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1.对同源蛋白质的PDB文件进行编辑。去掉无同源性的部分，去掉水分子，以形状更接近于球形的部分为模型。（如果model为多聚体，一般用单体作为模板）
2.使用CCP4将sca文件转化为mtz文件。（data reduction-->import merged data--填好文件路径等)
3. 使用cell content analysis进行蛋白质结构中的聚集态分析。（Molecular replacement-> analysis->cell content analysis) 马修斯系数预测溶剂含量在40-60%为正确的聚集态。（这个聚集状态在后面分子置换填写一个晶胞中寻找的蛋白质分子个数，及寻找model的copy数时有用。）
4.Run phaser
填写好相关参数。需要修改的选项：mtz文件，model文件， ensemble1，number of copies to search， protein Mw， number in asymmetric unit, 相似性百分比， 然后直接run就可以。
https://blog.sciencenet.cn/blog-385747-449696.html
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