对于植物而言，凡是绿色的部位基本上都能进行光合作用，种子也不例外。如豌豆（pea）和大麦（barley）的种子在发育早期就可以利用弱光进行光合作用，为植物体的生长提供还原力（ATP+NADPH）、为呼吸作用提供氧气。但并不是所有的“绿色”种子都能进行光合作用，如莲花（lotus）的种子就不能，Gradients of seed photosynthesis and its role for oxygen balancing.的作者认为有的种子之所以能进行光合作用，与他们所处的盐碱和干旱环境有关，但具体的机理还不明确。