没有人愿意两次掉进同一个陷阱,同样,生物体也进化出了各种机制防治被同一种病毒感染两次。人体以及其他高等生物产生的抗体能够记住他们感染过的病毒,从而防止第二次感染。最近三年来,研究人员惊奇的发现,单细胞的细菌也有类似的 ”
记忆性 ”
免疫叫做 ”CRISPR”
。这个故事起源于 2007
年,有一家出售用于生产酸奶的细菌的农业科技公司,客户反馈说他们收到的部分细菌感染了病毒,不能进行酸奶发酵。于是这家公司派出一个研究小组去调查此事。研究员同时对两类酸奶细菌做 DNA
测序。第一类是正常的对病毒免疫的好细菌,第二类是容易被病毒感染的不好的细菌。他们发现这两类细菌 DNA
唯一不同的是,在第一类细菌的 DNA
上多出了一小段,而且有意思的是这一小段 DNA
竟然和他们免疫的病毒完全吻合。后来一系列实验证明,就是这一小段 DNA
,就像是一个标签,让细菌记住了这个病毒。 这个实验发表之后引起了极大的轰动,由于是一个全新的领域,很多的问题暂时无法理解。但大概的思路是这样的。当病毒入侵进入细菌时,细菌的一个蛋白复合体能够截取一小段病毒的 DNA
,大约 20
个碱基 .
这一小段 DNA
能够镶嵌在细菌自己的基因组上 ,
并在细菌复制时传给下一代。当同样的病毒试图再次入侵此细菌时,这一小段 DNA
就会被转录成 RNA
,并且和外来的病毒 DNA
配对,如果碱基配对完全正确的话,细菌就会激活一个清除机制来清除此外来的病毒,从而防止被感染。
我是 2010三月份时开始进入这个领域的。我们发现, CRISPR具有更新换代的机制。简单说,细菌不可能一直不停的获取病毒 DNA片段,并插入到自己的 DNA中,这样的话细菌的 DNA就会无限制的增长了。一个细菌平均只能保留 20个病毒 DNA片段,那些老一点的片段就会慢慢的从细菌的 DNA中删掉。新的 DNA片段源源不断的添加进来,保证 CRISPR能提供最新的免疫。--Jiankui He and Michael Deem, Phys.Rev.Lett.105:198701 (2010)
关于 CRISPR 的研究还处于起始阶段,所有相关的文献不过 20 篇。但是这是一个全新的免疫的机制,它在细菌抗药性,细菌的基因转接等等方面有着巨大的潜在应用。免疫这一方向已经发了四个诺贝尔奖了,比如说我的合作者之一的 Andrew Fire 就因 RNAi 获奖, CRISPR 的发现很有可能再拿一个诺贝尔奖。 CRISPR
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