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化学生物学和生物有机化学之我见

已有 12852 次阅读 2008-10-19 01:36 |个人分类:生活点滴|系统分类:科研笔记

究竟化学生物学是怎样的一门学科呢?究竟和生物化学,生物有机化学有什么区别呢?这个问题可能看法并不一致。我个人认为可以判断一个课题是不是典型的化学生物学课题,而很难说一个研究组是不是化学生物学的组,或者一位研究者是不是chemical biologist。

那么一个典型的化学生物学project有哪些特点呢?首先是要解决一个生物问题。也就是说当你把你的工作拿到一堆生物学家中作报告时,要能够得到他们的认同。这个生物问题必须是他们所关心的问题。从这个角度上来讲,化学生物学是生物学。比如说Linda Hsieh-Wilson,Kevan Shokat, Carolyn Bertozzi 等他们能够得到生物学家的认同,被评为HHMI investigator。这是对他们在生物学领域做出贡献的认同。

其次是要有化学知识和工具的使用。所以posttranslational modification的研究一般来说比较像化学生物学。

主要的化学生物学期刊有Nature Chemical Biology,Chemistry & Biology, ACS Chemical Biology 和 ChemBioChem。

生物有机化学是有机化学,以合成为主,而这个合成是以生物活性为目标和基础。和medicinal chemistry比较接近。一般来说JACS上每期都有这样的文章。Bioorganic & Medicinal Chemistry 和 BMCL都是典型的生物有机化学期刊。

生物化学,则传统上是酶学和protein science,一篇文章通常学科跨度不大。经典的期刊是 biochemistry。

这样的学科划分其实很牵强,很模糊。事实上最多只能算是对现在这个三个学科的总结,而不是一个定义。而且和具体使用的工具无关,一个化学生物学的课题可以使用大量的生物化学的工具,有机合成,物化表征,新的分析手段等等。所以如果是赶时髦人人都说自己做化学生物学,那么会引起混乱。我是在化学系做这么多的生物学,归不到传统四大化学中的任何一项,实在不知道怎么定义自己,只能说我做的是化学生物学了。

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