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开博感想

已有 3970 次阅读 2010-12-18 01:14 |个人分类:生活点滴|系统分类:生活其它| 科研, 生物合成, 次生代谢

       等了三天,终于审核通过了,就写点东西。从小学开始语文一直都不好,所以也不怎么喜欢用写作来表达自己的观点,可是慢慢的随着自己的年龄的增长发现通过写作来记录自己的生活蛮重要的。最近,看了一些文献很有感触,更加坚定了自己对这个方向的信心。所以选择在这记录我科研以及生活的点滴。看了很多科学网上的博客,发现有很多大师,大牛,很多文章都很有意义。也促使我在这开博,作为开博的第一篇文章就简单的总结一下自己这么多年的生活。

         不能说是对科学很热爱吧,但是至少我一直是喜欢这个词的。从中学的时候开始,就特别喜欢那些科学家喜欢看他们的传记,但是一直以来都觉得这个跟自己遥不可及,所以很长一段时间并没有把自己跟科研联系起来。经常想起高中时候学生物时候的情形,那时候超级迷恋对书中所讲的那些前沿(包括培养番茄马铃薯杂交株,用植物细胞培养技术生产药物,基因工程等),也许正是这个原因使得我一直再追寻一个梦。有幸的是在大学的时候得到一次转专业的机会,从化学转到药学虽然从知识的角度并没有带给我多少改变,但是在思维想法上却给了我很多。研究生阴差阳错的录取结果更是给了我一个难得的机会,考研的时候一直联系的是邱老师,他也答应要我,所以直到开学的时候我才知道我的导师是赵老师,说来这个机会还真难得啊,虽然自己一直觉得对自己兴趣方向蛮了解,但是当时由于信息搜集的不够以为没有人招天然产物生物合成方向的研究生,所以就想着先做植物化学以后再换方向,说真的赵老师当时的招生方向是次生代谢考的是分子遗传学,与生物化学。要是考的话自己夸专业还真不一定能考上,现在能得到这样一个结果真的很满意,再说最近通过老师给的文献以及实验室之前的工作觉得跟自己的兴趣方向很符合,而且实验室之前做的工作都很有意义有水平,所以现在对自己的各方面都很满意。

            不知道是自己固执还是眼界比较窄,从一接触就开始喜欢上了次生代谢产物生物合成这个方向了,第一次接触这个概念是在大三的时候,当时学天然药物化学的时候王锋鹏老师在讲课的时候一直强调说生源学说很重要,而且始终对他概念里的一句话“次生代谢产物是有机体产生的自身生长非必需的一类化合物”不理解,从在即有合理性所以从一开始就有一个这样幼稚的问题,感觉比较有意思但是那时候自己所接触的资料有限觉得这个东西遥不可及以为研究生物合成就是简单的用同位素标记做前体喂养然后再分析生源假说,没什么意义。。。后来偶然的机会看到了加州大学Kesling用重组的大肠杆菌和酵母菌来生产青蒿素的研究,虽然当时并不知道他的机理或者具体的原理是什么,但是对我产生了一个很大的影响使我对这个方向充满了热情。后来在考研选择导师的时候也一直比较犹豫苦于没有跟这个相关的专业。

              真正对这个方向有一个清晰的认识是从这学期开始的,通过阅读专业的书籍以及文献对这个有了一个全新的认识,并且发现也没有自己想的那么神奇,现在想一下半年之前自己还什么都不懂以为国内没人搞这个,而现才知道上海有机所的刘文,唐功利,海洋所的鞠建华以及在国外的沈奔,唐亦,杜良成等很厉害。。。通过文献,书籍发现,其实在上世纪30年代国外就有很多人做这个方向,相对而言国内在这方面的研究确实很少,前期确实主要是通过同位素标记,粗提取物转化,等,近年来随着生物方法的引入,这方面出现了很多突破性的进展。

          目前这方面的研究主要是通过克隆对应的基因簇,然后将其中的基因逐个敲出再分析其代谢的中间产物,进而分析其生物合成途径。此外,随着聚酮类化合物生物合成机制的阐明(代表性的就是红霉素),提出了组合生物合成的概念,由此再加上近些年合成生物学的发展,目前跟次生代谢产物合成相关的研究都很热。最后总结一下最近一段看文献的成果说一下几个大的方向,以后再逐个分析

           1.关于安斯菌素类化合物生物合成中后修饰的反应顺序的确定以及其本质上的决定因素。

            2.关于聚同类生物合成的详细机制包括基因水平,酶学水平,这方面最近出现了突破性的进展,包括PT结构域的发现,以及与链长度有关的释放机制等,但是问题依然从在,最主要也是最有趣的一个是关于重复型I型聚酮合酶在还原程度,链的长度,以及甲基化位置数目的程序化控制

             3.基于基因资源的新的天然产物的发现,包括生物信息学结构预测,活化基因,表观遗传学,共生关系或者是改变条件等老活化沉默的生物合成基因簇

              4.完整的生物合成机制,包括从时间和空间上的理解,区室化效应,这方面最近也取得了很多突破性的进展,如在黄曲霉素生物合成中发现出现了一个转运粒来控制合成

               5.关于化学生态学,及次生代谢产物对有机体自身的作用一直是人们关心的一个问题,最近有关这方面的研究也不少

            今天就写这么多,以后有时间再详细的写,希望在这能够记录自己科研生活的点滴

          



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