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“中国自然标本馆”简介

已有 10957 次阅读 2010-2-1 22:01 |个人分类:生活点滴|系统分类:科研笔记| 生物多样性, 自动化管理, 自然标本馆, CFH

人类的生存离不开自然界,认识自然万物既是人类生存的本能,又能满足好奇心与审美需求。随着数码相机的普及,人们可以很方便地将认识的、不认识的动物、植物、真菌拍摄下来。随之而来几乎困扰每个人问题是,它们是什么,叫什么名字?照片多了,怎么管理?很多人购买数码相机走进自然后,都经历过好奇心强烈,疯狂拍照的阶段,但照片积累多了,求解无门,管理乏力,难免兴趣逐渐减淡,最终到达索然无味的境地,能够把认识自然的数码摄影坚持下来有效积累起有价值的资料并能与大家分享的人为数不多。爱好者在资料与知识上需要互通有无,疑难问题需要专家帮助解疑,专家也需要更多的研究资料。同时,每个人需要对自己的资料进行有效整理。因此,急需一个让拥有相同兴趣的朋友们进行有效互动、自动整理与积累的平台,大家既能发挥各自的特长,又能各取所需,共同进步。

中国自然标本馆”(Chinese Field Herbarium,简称CFH)是中国科学院植物研究所建设的生物多样性信息网络平台,致力于为用户生物多样性数据的采集、管理、利用以及相互的交流提供解决方案,并将广泛的志愿者力量综合起来,推动大范围的生物多样性本底调查工作,不仅仅是一个图库。该平台早自2005年即开始构思,2007年实际开始建设,2008年2月第一版上线,2009年6月升级到第二版。目前网站已有超过1000个注册用户,68万多张国内外的自然生态照片,已鉴定出1.1万种植物。

一、网站的分类学基础是物种库。网站使用最新版本的Species2000物种名录,力求在分类学基础部分能利用最新的分类学科研究成果。在具体的物种名称应用中,网站提供了同名异物、同物异名的处理环节,用户可以使用任一已被收录的名称为入口,找到目标物种。物种库查询入口:http://www.nature-museum.net/Spdb/default.aspx中文名查询时建议使用简体字,拉丁名查询时请勿在检索词中带命名人。)查询结果有名称、分类系统及照片相关信息。

各领域的科学知识在框架、概念上都具有从大到小、从粗到细的阶元结构,在生物领域尤为明显,生物分类系统大概是人类知识体系中最复杂的分类系统。CFH物种库能收录任意结构的分类系统,相关分类系统间能实现无缝衔接。CFH的物种树由大量分类系统构成,向外可以扩展到生物以外的知识领域,向下可以扩展到各物种之下的品种分类系统。其局部的分类系统树,除了可以在总树上逐步展开进行浏览外,也可通过物种库的查询,在查询结果中直接进入到相关的子树。

二、网站处理的数据主要以照片为载体。CFH收录一切与生物有关的图片,以相册为基本组织单元。新用户注册登录之后,可以在我的图库中建立相册并上传,或者浏览其它用户已建立的相册与用户个人图库。相册中支持WebGIS功能,可以计算出每张照片的GPS坐标并在地图上显示拍摄地点。物种鉴定是每个人都很关心的问题。网站提供很多种物种鉴定方式:
用户图片文件名中的物种信息在图片上传时自动提取生成鉴定签。这样可以充分利用大家已经做过的鉴定工作,避免重复劳动。
用户在相框上快速鉴定框直接输入鉴定名。
用户在相框的鉴定历史中选择一个类群名称进行鉴定。
用户在相框下的完整鉴定签中输入鉴定名与鉴定人、鉴定备注等信息。
在相册界面下选择多张照片进行批量鉴定。

在这些鉴定过程中,用户只需输入物种名称即可,物种的其它信息、鉴定时间、鉴定人等由程序自动补全,实现自动化。在完整鉴定签与批量鉴定时,可以对名称的同名异物、同物异名进行处理。可以使用任何等级的阶元名称进行鉴定。物种鉴定除了本人进行外,其它人也可进行鉴定,大家互相帮忙,实现从粗到精的在线互动。

三、CFH实现了基于分类系统树的自动整理功能。照片一旦有了一个鉴定名称,网站会根据照片的鉴定名,使用分类系统树自动整理,一步到位地解决照片的整理问题。这是全站所有已鉴定照片形成的分类系统树:http://www.cfh.ac.cn/Album/ShowByTaxonTree.aspx
这棵树太庞大,如果想看某特定类群,例如某个科的树,可以通过查询进入这个科的信息页面,点开查询结果中该节点下的分类子树即可。例如:
http://
www.nature-museum.net/Spdb/default.aspx
http://
www.nature-museum.net/spdb/TaxonNodeTree.aspx?spid=664

在每个相册、每个用户的个人图库中都有一套多种格式的物种树,对相关数据进行自动整理与统计,完全免除了大家手工整理照片的麻烦,对自己有多少照片,有哪些物种的照片有了准确的明细账。例如,博主本人的个人图库已有5万多张照片,物种名录中有简单名录、普通名录、带图名录等三种名录格式,名录有自动的科属种数量统计,可以打印、下载,还可以用名录树来查看全部照片。在此之前,博主曾尝试使用科属种文件夹来管理照片,非常之繁琐,效率很低,整理几千张后就坚持不下去了,剩下数以万计的照片只以最原始的拍摄文件夹命名保存。有了这套自动整理系统,可以按调查工作的开展情况自然地分别建立相册,然后由网站自动进行名录整理与排序,完全解决了博主照片管理的烦恼。

四、CFH支持建立各种主题性的分站。除了每个用户有自己的个人图库外,还可以由若干用户形成一个团队,建立主题网站,大家将各自与此主题相关的相册共享合并到一起,大家共同管理,合作建设、维护,特别适合于生物实习、特定项目、兴趣小组等的相关人员建立自己的网上协同合作平台。已建站点:
http://
www.nature-museum.net/Subsite/SiteList.aspx
每个站点都可以使用自定义的网站标志,甚至使用自己的域名。建立站点的方法:
http://www.planta.cn/forum/viewtopic.php?t=18932
博主的朋友建立的高校植物资源站点:
http://www.nature-museum.net/subsite/Albums.aspx?siteid=taxus

自然保护区的站点:

http://www.nature-museum.net/subsite/Albums.aspx?siteid=gutianshan

五、CFH将提供对外数据引用。在CFH上浏览照片的最大好处是每张照片都紧密地跟随着最新的采集、鉴定等附属信息,同时保存着所有的历史鉴定信息。上传到CFH的照片及其相关信息,可以用Flash打包之后提供给博客、论坛等各种场合引用,照片的相关鉴定信息与CFH的最新鉴定保持同步,解决当前各种博客、论坛中贴图与大家对图片的鉴定意见脱节的问题。具体请参考:http://bbs.cfh.ac.cn/showtopic-95.aspx


CFH的功能体系还在不断开发之中。本文作为引子仅作简单介绍,将陆续增加细节功能、使用方法的具体介绍。欢迎前往免费注册试用,提出意见和建议。



https://blog.sciencenet.cn/blog-247940-291946.html


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