grompp -f dppc_bilayer.mdp -c dppc.gro -p dppc_bilayer.top -o dppc.tpr -maxwarn 5
mdrun -s dppc.tpr -o dppc.trr -c dppc.gro -e dppc.edr -g dppc.log
genconf -f water.gro -nbox 7 7 2 -c -o water7.gro
editconf -f dppc_bi.gro -bt cubic -box 24.5 24.5 16.5 -o dppc0.gro
genbox -cp dppc.gro -cs water.gro -o dppc_water.gro -maxsol 71200
ngmx -f traj.trr -s mpw.tpr -n mpw.ndx
trjconv -f traj_0.trr -s npt.tpr -o 4000.gro -dump 4000 提取gro
trjconv -f traj.xtc -s npt.tpr -o time_260ns.gro -dump 260000
g_msd -f traj_nojump.xtc -s npt.tpr -o msc150.xvg -b 20000 -lateral z -endfit 10000
https://blog.sciencenet.cn/blog-90936-289033.html
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