病毒是细胞的衍生物，是一类高度进化的物种， 病毒的进化方向是与细胞共生，地球上所有的物种包括人类在内，都有相应的共生病毒。病毒是物种进化的动力之一，是生命世界不可缺如的基础成员，在生命网络中有其重要地位。

 

 

 

1病毒是细胞的衍生物：病毒是从何而来的呢？近年来随着“RNA世界“研究的进展和生物膜囊泡的研究进展提示了生物大分子进化与生命前原始细胞的成长过程，不管生命发生于地球还是天外来客，从一个无生命体系中造就一个自我维持与繁衍的进化体系的基本环节已经清晰。病毒样结构不具备独立存在与自我进化的机制，不可能出现在细胞产生之前。因此病毒组成虽比细胞简单，却不是细胞的祖先；相反，病毒的生命运动依赖具有完善核酸及酶生化系统的细胞，在物质组成要素上细胞是同源的，所有成分均可来源于细胞，没有细胞不仅病毒无以存在，人类也无法发现与鉴定任何一种病毒，因此病毒来源于细胞的起源学说已得到大多数科学家的认可。病毒基因（核酸）运动的方式及场所与细胞完全一致，依赖细胞存在并进化，在某种意义上说，是细胞基因运动的支流，物种进化的本质是基因的变化，这条支流与主流分分合合，对促成这个纷繁复杂、绚丽多彩的生命世界作出了巨大的贡献。

 

2病毒是一类进化快速的物种：病毒结构简单，需要寄生于细胞，但其具有独立的结构、遗传物质、物理化学特征与生活周期，与其它微生物一样，应该看作是一类物种；其能在细胞外以无生命代谢状态长时间存在是生命周期中的一种方式。然而病毒基因的结构与基因组成之精练，却远在细胞之上；其自我复制和自我更新以适应环境的生存活力与效率，也是细胞不能比拟的。如艾滋病毒只有9749个碱基，组成了9个基因；HBV3200个碱基，组成4个基因，核酸个个“有用”，基本没有“闲置”不用的核酸序列，有些序列甚至被不同基因重叠使用；而与之相比，细胞的碱基数量简直是天文数字，以人类细胞为例，30亿对碱基，其中含有大量无用的或重复的核酸序列，真正发挥基因作用的只占总碱基量的1%。这表明病毒虽然细小，但并不是原始粗糙的物种，由于病毒在细胞内生长，可共享细胞内完善的酶生化系统完成自身的复制与增殖，不需要保留能借用于细胞的功能基因，在进化过程中通过逐步“丢失”而清除累赘，以适应其快速增殖发展和寄生于细胞内相对狭小的环境中发展的需要，因此其发展规律是向小而精发展，同时也产生了高效简洁的病毒特有的基因序列。病毒与细胞核酸数量的巨大差距，以及病毒基因的高效与精简，表明病毒自细胞衍生而来，伴随整个生命世界发展，已经是一类高度进化的物种，以往我们将病毒看作介于生命与非生命之间的一种原始生命状态或准生命物种是一种“误解”。

 

3病毒的进化方向是与细胞共生：阐明病毒之源是细胞，那么源于细胞的病毒离开细胞后再进入同类细胞，按理与细胞是相容的，病毒的基因活动和生活周期虽然独立于细胞，但以不影响细胞的生存繁殖为底线，与细胞相容共存是病毒能够生存的基础，因此通过不断进化，所有的病毒均有其长期寄生的宿主。但病毒为自身的发展有跨物种扩散的倾向，当病毒通过变异获得入侵别的物种细胞的性能时，给别种宿主细胞带去了新的基因及其相应产物，就会演绎出一系列新的矛盾与冲突：如新基因功能有利于细胞的增殖与生存，则融入细胞基因使细胞更新；反之则细胞消亡，这株因变异能跨物种入侵的病毒株自身也消失了。在某些状况下病毒与新宿主发生冲突但不至于双亡，病毒群体存在毒力差异，对宿主毒力大（如造成宿主死亡）的病毒株自身也将无以存在，而相对无害的病毒株与宿主共同得到延续。随着传代，病毒与新的宿主有一个从不相容至相容的渐变过程，因此病毒有“传代减毒”的自然特征，免疫预防用的病毒减毒活疫苗就是以传代的方法生产的。跨物种发展以及与细胞相容性的改善也是病毒进化的普遍规律。由于病毒在发生上的多源性，各种病毒的组成、结构、形态与生存方式有很大的差异，造成病毒整体种类上的无序性，至今病毒学上没有一种另人满意并合理的分类法，其实病毒发展也是有序的，沿着与所有细胞共生的轨道演化。

 

4 免疫系统的发生；所有的物种都有保持自身遗传物质稳定的倾向，病毒入侵干扰了宿主遗传物质与内环境的稳定，因此促使了宿主免疫系统的出现，在物种进化树中，从三文鱼开始就出现原始的免疫系统了。免疫系统功能是识别与清除外来抗原（以蛋白质为基础），其识别信息是在抗原分子的三维立体结构上，通过识别与清除有别于自身的抗原而清除病毒颗粒以及有病毒抗原膜表达的感染细胞，但没有进入细胞内识别外来核酸序列的功能，因此一些病毒在免疫反应已存在的状况下仍可长期驻留细胞内，但免疫反应的压力可使病毒局限在有限的细胞内，抑制病毒基因及其相应产物扩散，免疫系统的出现使病毒的入侵以及病毒基因的掺入受到极大的限制，保护了宿主遗传物质和特征的稳定性。但从组织系统发生学上分析，免疫系统对抗病毒就有其先天的局限性，如果病毒能通过宿主胚胎发育过程传播，免疫系统会将病毒认作自身物质而耐受，病毒就免除了与免疫系统的对抗而成为一种“内源性”病毒与宿主长期共存。