EasyCGTree version 4.2在2023年正式发表的4.1版本基础上有了明显的改进：

4.2版支持基因组的核酸序列和蛋白质序列（proteome）的混合输入。4.1及之前版本不支持核酸序列。

如果检测到输入数据中的某个基因组为核酸序列，则使用prodigal进行CDS预测；若为蛋白序列则直接使用。

因此-proteome已经无法很好地指示对输入数据的接受范围，所以改成-input。其他参数与4.1版基本一致。

更多信息可查阅软件包内的使用手册和readme文档。

EasyCGTree简介请参考4.1版的博客。

https://blog.sciencenet.cn/blog-548406-1406360.html 

软件下载地址：

https://github.com/zdf1987/EasyCGTree4

https://gitee.com/zdf1987/EasyCGTree4

EasyCGTree论文链接：http://dx.doi.org/10.1186/s12859-023-05527-2