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Maxent模型物种分布模型相关研究:
基于MaxEnt模型的气候变化对海南岛湿地景观潜在分布的影响
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基于MaxEnt模型预测梅的潜在适生区分布
基于组合物种分布模型的长棘海星与褐拟鳞鲀适宜生境及其对气候变化的响应 .
川滇高原高寒草甸生态系统不同功能群植物分布格局的MaxEnt模型预测
基于MaxEnt模型的大果青杄潜在适生区及其分布变化
基于R语言、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作实践技术应用
第一章 以问题导入的方式,深入掌握原理基础 【理论篇】
1、R语言入门:
(1)安装R及集成开发环境(IDE);
(2)R语言基础语法与数据结构,包括:程序包安装、加载、更新,数据读取与输出,ggplot2常规画图等。
2、MaxEnt模型:
(1)什么是MaxEnt模型?
(2)MaxEnt模型的原理是什么?有哪些用途?
(3)MaxEnt运行需要哪些输入文件?注意那些事项?(40融合R语言的MaxEnt模型的优势?
第二章 常用数据检索与R语言自动化下载及可视化方法
1、数据类型与来源
常用数据下载网站(包括:气候、土壤、水文等,GBIF)
2、多途数据获取与可视化
1)手动收集
2)网站获取
3)R语言命令行自动下载与可视化
3、栅格数据预处理
栅格数据信息查看、统计和可视化;
栅格数据掩膜提取、裁剪、镶嵌、重采样、滤波等
第三章 R语言数据清洗与特征变量筛选
1、数据清洗
原则:错误点、重复点、缺少点等
方法: 代码筛选/ Arcgis筛选
2、变量筛选与最佳组合的选择:
主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)与Boruta 算法
第四章 基于ArcGIS、R数据处理与进阶
1、ArcGIS安装与入门
2、利用ArcGIS进行模型数据准备
3、进阶:基于R语言的数据准备
第五章 基于Maxent的物种分布建模与预测
1、Java、MaxEnt安装与模型界面说明
2、数据输入与参数设置
3、输出结果分析
第六章 基于R语言的模型参数优化
1、参数敏感性分析:正则化常数与特征变量组合
2、参数优化原理与实操练习
3、模型评价: ROC、AUC、TSS等参数进行模型结果评价
第七章 物种分布模型结果分析与论文写作
1、物种分布特征分析:时空尺度与物种分布
2、高质量结果可视化
3、论文模板总结与写作指导:包括创新点确定、论文结构构建
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