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[转载]Frontiers in plant science||烟草CAD基因家族的全基因组鉴定及功能分析

已有 68 次阅读 2024-7-17 11:29 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

肉桂醇脱氢酶(CAD)在木质素的生物合成中起着至关重要的作用,编码多种CAD同工酶的基因家族已在许多植物中被克隆和鉴定。然而,目前关于烟草中CAD基因家族的信息非常有限。本研究对三种烟草(Nicotiana tabacumN. tomentosiformisN. sylvestris)的CAD基因进行鉴定,结果显示这些烟草CAD的核苷酸和氨基酸序列具有高度的相似性,推测的蛋白质序列保守地具有两个Zn2+结合基序和一个NADP (H)辅助因子结合基序。NtCAD1NtCAD2都具有保守的底物结合位点,来自系统发育分析和表达谱的证据支持它们作为参与木质素生物合成的真正CADs的作用。

NtCAD1有两个同源基因,NtCAD1-1NtCAD1-2。酶活性分析表明,NtCAD1-1NtCAD1-2对针叶醛、香豆醛和芥子醛具有较高的亲和力,而NtCAD2则以针叶醛和对香豆醛为底物。动力学参数分析表明,NtCAD1-2是最有效的酶。NtCAD1-1NtCAD1-2均下调,导致茎呈红褐色,但木质素含量没有显著变化。此外,NtCAD1-1NtCAD1-2NtCAD2在生物和非生物胁迫以及不同植物激素中表现出不同的表达模式。研究结果表明,NtCAD1-1NtCAD1-2参与了木质素的生物合成,其中NtCAD1-2也参与了生物和非生物胁迫,而NtCAD2主要在烟草响应生物和非生物胁迫中发挥了独特的作用。

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图片1题目

Genome-wide identification of the CAD gene family and functional analysis of putative bona fide CAD genes in tobacco(Nicotiana tabacum L.)

图片2杂志

Frontiers in plant scienceIF=4.1

图片3链接

Wu M, Li Y, Liu Z, Xia L, Xiang Y, Zhao L,Yang X, Li Z, Xie X, Wang L, Wang R, Xu S and Yang J (2024) Genome-wide identification of the CAD gene family and functional analysis of putative bona fide CAD genes in tobacco(Nicotiana tabacum L.).Front. Plant Sci. 15:1400213.doi: 10.3389/fpls.2024.1400213

图片4检测指标

Norminkoda提供木质素单体GSH检测

图片5主要内容

图片结果1:烟草中CAD基因的特征: 

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结果2:烟草中NtCAD基因及其编码氨基酸的鉴定矩阵

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 结果3:烟草及相关植物的CAD同源性分析

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结果4CAD同源物的系统发育分析

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结果5NtCADs和拟南芥CADs的比对

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结果6:烟草CAD基因在染色体上的定位

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结果710NtCAD基因的外显子/内含子结构组织分析

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 结果8NtCAD基因在不同烟草组织中的表达谱

图片 结果9NtCAD1NtCAD2的最佳pH值和温度条件研究

图片 结果10NtCAD1NtCAD2的动力学分析

图片结果11:建模分析

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结果12CAD基因下调对木质素含量没有任何显著影响

图片 结果13GS-MS鉴定木质素单体(G、S、H)

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结果14:环境条件的胁迫研究

图片6总结本研究在烟草N. tabacum中鉴定出10CAD基因,烟草N. tomentosiformis中鉴定出4个基因,烟草N. sylvestris.中鉴定出6个基因。通过遗传进化分析基因表达分析在不同的烟草组织中进行的研究提供了令人信服的证据NtCAD1-1NtCAD1-2可能参与木质素的生物合成,因为它们在根和茎中表现出高表达水平酶活性分析显示,NtCAD1NtCAD2体外抗羟基肉桂醛活性,NtCAD1-2的效率最高。NtCAD1-1NtCAD1-2的下调导致茎呈红褐色,但木质素含量没有显著改变,这一观察结果可归因于针叶树醛的积累或富集。三种NtCAD表现出不同的反应,对生物/非生物胁迫和植物激素;值得注意的是,所有测试条件对NtCAD1-1的表达均显著降低或轻微影响,而热胁迫、暗胁迫和病原体感染诱导NtCAD1-2的表达;相反,冷/热胁迫以及ABASA处理诱导NtCAD2的表达。总之,本研究结果为烟草中的NtCADs提供了一个全面的分析,并强调了NtCAD1NtCAD2在木质素生物合成中的潜在作用,然而,还需要进一步的研究来阐明NtCAD1下调后木质素含量未改变的确切机制。

声明:本文内容及图片部分来源于已见刊的文献,内容观点仅代表个人解读,具体参考原文.



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