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背景:肌内脂肪(IMF)与肉质的嫩度、大理石花纹、多汁性和喜爱程度密切相关。作者采用理化指标,转录组和代谢组相结合的方法研究了秦川牛不同肌肉部位肌内脂肪的变化机制。
结果:秦川牛肉中IMF含量较高,且各部位肌肉中IMF含量不同,分别为上脑(15.86%)、眼肌(14%)、外脊(10.44%)和里脊(8.67%),CCDC80和HOX基因簇可能调节肌肉脂肪组织沉积。此外,芥酸(EA)是秦川肉牛的主要代谢产物,在IMF中含量较高。IMF的沉积可能受到涉及EA和ACOX3、HACD2和SCD5基因的不饱和脂肪酸代谢途径的调节。此外,不同表达的基因和代谢产物在三个主要的KEGG途径中富集:嘌呤代谢、嘧啶代谢以及甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢。
1题目
Integrated multi-omics analysis reveals variation in intramuscular fat among muscle locations of Qinchuan cattle.
2杂志
BMC Genomics; IF4.4分(2023)
3链接
Yu, H., Wang, J., Zhang, K. et al. Integrated multi-omics analysis reveals variation in intramuscular fat among muscle locations of Qinchuan cattle. BMC Genomics 24, 367 (2023). https://doi.org/10.1186/s12864-023-09452-9。
4检测指标
Norminkoda提供总脂肪含量检测。
5主要内容
Fig 1:转录组和表型的基础分析。
Fig 2:DEG的GO注释分析和KEGG通路富集分析。
Fig 3:样本之间DEM的热图和火山图.
Fig 4:转录组和代谢组数据的WGCNA和KEGG途径富集分析。
Fig 5:肌内脂肪(IMF)调节的潜在分子机制。
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