犬狂犬病毒传播动力学的建模

——大型学术专著《狂犬病》最新版新增的第二章

　　 目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控（RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年，第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版（第4版）于2020年5月出版，共有22章，732页。与前一版相比，最新版新增了两章，体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。

原书内容丰富，本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之二：第20章－犬狂犬病毒传播动力学的建模。

本章目录：

1. 引言

  1.1. 狂犬病毒传播动力学建模的历史

  1.2. 犬狂犬病模型的主干（backbone）

  1.3. 如何模拟狂犬病毒的传播?

2.  现有模型研究

  2.1. 优点和局限性

3.  模型与数据之间的差距

  3.1. 咬伤数据

  3.2. 实验室确诊病例数据

  3.3. 序列数据

  3.4. 犬类种群和疫苗接种数据

4. 结论 

第20章－犬狂犬病毒传播动力学的建模(Modeling)(8)

20.3.  模型与数据之间的差距(1)

The gap between models and data

 尽管监测有限，但很少有研究将观察模型纳入分析，或对上报资料欠缺可能导致的推断偏差进行敏感性分析(图20.2D)。开发观测过程的模型并将其集成到传播动力学模型中，通常称为状态－空间建模（state-space modeling）(Beyer等人，2010;Beyer et al.， 2012;Cori等人，2018)，在拟合不完整的数据时是必不可少的。但是，这些建模框架也可以通过估计最低检测水平和验证狂犬病消除所需时间来指导整个监测策略 (Townsend, Lembo, et al., 2013)。

许多现有建模研究的一个主要限制是缺乏数据来支持结论，只有不到40%的模型与数据拟合(图20.2D)。对于报告了病例数据的研究，数据的规模和质量也有很大差异。在国家或地区一级报告的人类死亡人数以及临床和实验室确认的动物病例数是最常用的数据(图20.3A)。观测的数量和时间序列的长度变化很大，从15年的精细时空尺度上的1,000多个观测到仅2年的年度病例报告(图20.3B)。最终，将狂犬病发病率和犬类数量的数据整合到传播模型中是推动建模工作向前发展的关键一步。现在，我们将描述可用于拟合模型并为其提供信息的各种数据源，以及收集这些数据的相关挑战和解决方案。

20.3.1 咬伤数据(Bite data) 

 咬伤数据(即因动物咬伤而寻求治疗的患者数据)经常被用作狂犬病暴露发生率的替代指标。然而，这些数据往往缺乏咬人动物状况的详细信息，并且在地理和社会经济上受到谁能获得护理的严重影响。矛盾的是，在PEP（暴露后预防）的直接费用由患者承担的情况下，咬伤记录可能更能反映狂犬病暴露的情况。由于相关费用较高，当感知风险较低时，人们可能不太愿意寻求治疗(即，因已知是由健康和/或接种过疫苗的动物引起的咬伤而寻求治疗的人较少)(Changalucha et al., 2018; Hampson et al., 2008)。在免费和不加区别地提供PEP的环境中，报告的咬伤比例较高可能是由于包含了大量由未患狂犬病的动物造成的咬伤(Rajeev等人，2018;Rysava et al.， 2018;Wallace等人，2015年)，以及许多1类暴露，即不符合PEP指征的暴露(Rabies vaccines: WHO position paper, 2018), 接受了不必要的PEP(Duong et al., 2016; Rajeev et al., 2018; Tenzin, Dhand, & Ward, 2011)。

为了使被咬伤患者的数据对建模和监测更有用，需要对每次咬伤提供报告日期和接受疫苗的剂量以外的补充信息。按照世卫组织的分类对暴露类型进行分类有助于排除第一类暴露。在每次患者就诊时报告咬人动物的临床症状和结局，可以确定可能的狂犬病暴露，并触发现场调查和样本收集，以改进监测。最后，患者被咬的地理位置信息，例如可识别的最精细行政单位，可用于了解传播的空间模式，估计PEP需求，并确定就医行为的决定因素。

（未完待续）

相关链接：

Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编，《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT（狂犬病的科学基础和管控）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版（第４版）共有22章，732页，由Elsevier Inc.旗下的学术出版社（Academic Press）出版。

Rabies - 4th Edition (elsevier.com)Rabies | ScienceDirect

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