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犬狂犬病毒传播动力学的建模
——大型学术专著《狂犬病》最新版新增的第二章
目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控(RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT)》,简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年,第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版(第4版)于2020年5月出版,共有22章,732页。与前一版相比,最新版新增了两章,体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。原书内容丰富,本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之二:第20章-犬狂犬病毒传播动力学的建模。
本章目录:
1. 引言
1.1. 狂犬病毒传播动力学建模的历史
1.2. 犬狂犬病模型的主干(backbone)
1.3. 如何模拟狂犬病毒的传播?
2. 现有模型研究
2.1. 优点和局限性
3. 模型与数据之间的差距
3.1. 咬伤数据
3.2. 实验室确诊病例数据
3.3. 序列数据
3.4. 犬类种群和疫苗接种数据
4. 结论
第20章-犬狂犬病毒传播动力学的建模(Modeling)(3)
20.1.2 犬狂犬病模型的主干(The modeling backbone for canine rabies)(续)
图20.1 犬狂犬病易感-暴露-感染-疫苗接种(SEIV,Susceptible-Exposed-Infectious-Vaccinated )模型框架:
圆圈表示流行病学类别,连接圆圈的箭头表示个体如何在类别之间移动,插图描述潜在的过程和影响。
(A) 宿主群体数量统计( demography,即出生和死亡之间的平衡)和疫苗接种决定了易感群体和疫苗接种群体的动态。在疫苗接种战役之后,疫苗接种覆盖率(插图的y轴)首先增加(垂直跃升),然后逐渐下降,是伴随着接种了疫苗的个体死亡、易感个体出生或疫苗接种所带来的免疫的下降(x轴)(在本例中,疫苗接种战役每年达到群体的70%,但在下一次年度疫苗接种战役之前覆盖率下降到约35%)。
(B) 传播率( Transmission)平均较低,但异质性很高。插图显示了负二项分布(n=1000例,平均继发病例数=1.2,红色虚线显示)产生的继发病例数。
(C) 个体从暴露到感染( from exposed to infectious)的平均时间为22.3天(插图,虚线),但这也是高度可变的,有些感染发生在暴露数月至1年后。
(D) 疾病完全致死,感染(发病)期短,平均3.1天(虚线),感染引起的死亡发生在发病后的10天内。
(E) 从外部引入建模种群的感染可能在内部播下病例的种子。传染的引进可能是由于已感染犬携带疾病的移动(有时超过10公里;插图显示了扩散距离, γ-伽马分布),和人类介导的处于潜伏期的犬的运动(可能在100公里的范围内沿着道路移动;插图显示了坦桑尼亚一个主要道路网络的例子)。所使用的所有参数和相关参考文献如表20.1所示。
表20.1 与图20.1所示基本过程相关的关键参数值。
Process过程, Distribution分布, Parameters参数, Value数值, Source 来源,Inset插图
Birth rate 出生率
Death rate 死亡率
Vaccine waning疫苗效力衰减
Secondary cases继发病例
Incubation period 潜伏期
Infectious period 感染(发病)期
Dispersal kernel 扩散距离
(未完待续)
相关链接:
Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编,《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT(狂犬病的科学基础和管控)》,简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版(第4版)共有22章,732页,由Elsevier Inc.旗下的学术出版社(Academic Press)出版。
Rabies - 4th Edition (elsevier.com)Rabies | ScienceDirect
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