狂犬病毒的进化

——大型学术专著《狂犬病》最新版新增的一章

    目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控（RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年，第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版（第4版）于2020年5月出版，共有22章，732页。与前一版相比，最新版新增了两章，体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。原书内容丰富，本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之一：第３章－狂犬病毒的进化。

本章目录：

3.1 概述

3.2 狂犬病毒在稳定的宿主－病毒关联中的微观进化动力学

3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学

3.4  适应性进化在跨物种传播中的作用：调和（Reconciling）毒株提供的证据

3.5 进化数据在狂犬病预防和控制中的应用——遗传学作为传播的标签

3.6 结论

第３章－狂犬病毒的进化(10)

3.5 进化数据在狂犬病预防和控制中的应用——遗传学作为传播的标签(3)（Applications of evolutionary data for rabies prevention and control—genetics as a tag on transmission） 

通过RABV（狂犬病毒）的公共卫生和兽医监测收集到的数据，其数量和质量都非常可观，这有助于将进化数据整合到狂犬病管理中。蝙蝠和食肉动物狂犬病的一个显著流行病学特征是由点源引入然后导致动物流行病的波浪式传播 (Benavides et al.,2016; Biek et al., 2007; Pepin et al., 2017)。使用最近开发的系统地理学工具（phylogeographic tools）可以很容易地识别和表征这些入侵(Dellicour,Rose，& Pybus,2016;Lemey, Rambaut, Welch，& Suchard,2010)。特别是当受到山脉或河流等地理屏障的限制时，就像在吸血蝙蝠和浣熊的狂犬病流行中分别观察到的那样，传播是可以预测的 (Benavides et al., 2016; Real et al., 2005; Russell, Smith, Waller, Childs, & Real, 2004; Smith, Lucey, Waller, Childs, & Real, 2002; Streicker et al., 2016)。这可能允许以证据为基础设计针对自然宿主或溢出宿主(如人类或家畜)的疫苗通道（corridors）的位置和宽度。即使在RABV流行地区，分子工具在确定病毒持续存在和传播的决定因素方面也越来越有用，这最终可以为管理提供信息，例如可分别将疫苗接种运动推进到对病毒维持或缓解人类介导的病毒传播最关键的地区 (Bourhy et al., 2016; Brunker et al., 2018; Brunker, Hampson, Horton, & Biek, 2012; Streicker, Gonza ´lez, Luconi, Barrientos, & Leon, 2019; Talbi et al., 2010)。

对RABV变种进行快速和精确鉴定的需求日益增加，特别是当需要应对对无狂犬病地区的新入侵时。例如，在过去的几十年里，加拿大靠近美国边境的许多地区都经历了浣熊狂犬病的爆发，这是通过疫苗接种通道引入的，该通道原本旨在遏制美国一侧的流行地区。Trewby等(2017)使用来自边境两侧的RABV基因组数据来确定此类入侵的潜在来源种群，并更好地了解导致这些入侵的过程。他们发现，大多数疫情是由病毒在疫苗接种区附近的局部传播和短距离扩散引起的。 在某些情况下，这涉及病毒跨越边境的反复移动，表明疫苗通道被更有系统地破坏了。同样，遗传来源归因技术（genetic source attribution）在实现狂犬病消除后又发现病例的情况下发挥重要作用，例如可将该技术应用于广泛的犬类疫苗接种运动之后 (Brunker et al.,2015)。 虽然来自单个基因的序列数据足以广泛地表征新兴毒株并建立它们与先前观察到的变异株的关系，但可能需要全基因组数据来获得足够的系统发生分辨率以进行更精确的定位。由于高通量测序技术（high-throughput sequencing technologies）变得越来越廉价和便利，这些数据可以越来越多地在现场生成，预计这将成为RABV消除和控制计划中越来越常用的技术(Brunker, Nadin Davis,& Biek,2018)。基于模型预测的战略规划仍然相对不常见，但这是一个新兴领域，进化数据可以合理地促进现有的RABV控制。

（未完待续）

相关链接：

Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编，《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT（狂犬病的科学基础和管控）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版（第４版）共有22章，732页，由Elsevier Inc.旗下的学术出版社（Academic Press）出版。

Rabies - 4th Edition (elsevier.com)Rabies | ScienceDirect

相关博文：

权威的大型学术专著《狂犬病（Rabies）》最新版已面世 2020-6-29

权威学术专著《狂犬病（Rabies）》第４版继续充分肯定“十日观察法”  2020-7-1

狂犬病的发病机理：研究现状和未来的挑战  2021-11-26

病毒灭活：狂犬病疫苗生产中的一个关键步骤 2021-11-24

狂犬病毒的进化 (1) 2023-12-17

狂犬病毒的进化(2) 2023-12-19

狂犬病毒的进化(3) 2023-12-21

狂犬病毒的进化(4) 2023-12-22

狂犬病毒的进化(5) 2023-12-24

狂犬病毒的进化(６) 2023-12-27

狂犬病毒的进化(7) 2023-12-28

狂犬病毒的进化(8) 2023-12-31

狂犬病毒的进化(9) 2024-01-02