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狂犬病毒的进化(６)

已有 2023 次阅读 2023-12-27 00:52 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦

狂犬病毒的进化——

大型学术专著《狂犬病》最新版新增的一章

目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控（RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年，第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版（第4版）于2020年5月出版，共有22章，732页。与前一版相比，最新版新增了两章，体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。

原书内容丰富，本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之一：第３章－狂犬病毒的进化。

本章目录：

3.1 概述

3.2 狂犬病毒在稳定的宿主－病毒关联中的微观进化动力学

3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学

3.4 适应性进化在跨物种传播中作用的证据：调和（Reconciling）毒株

3.5 进化数据在狂犬病预防和控制中的应用——遗传学作为传播的标签

3.6 结论

第３章－狂犬病毒的进化(６)

3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学(３)

（Macroevolutionary dynamics of rabies）

　　虽然从RABV（狂犬病毒）的系统发生来看，多次历史性的宿主转移（host shifts）是显而易见的，但它们发生的时间、地点和环境在很大程度上仍不确定。这包括缺乏提供病毒的宿主物种和接受病毒的宿主物种的精确信息，因而随后的宿主转移和谱系灭绝（lineage extinctions）可能导致对现存的RABV谱系只能提供不完整的历史过程的描述(图3.4)。然而，在当代发生了许多宿主转移的例证，其中一些已经被相当详细地记录下来(图3.5)。这些案例可以为RABV在新宿主中出现时所涉及的因素提供有用的见解，包括更好地理解进化在这一过程中的作用。我们在这里将宿主转移（host shifts）定义为跨物种传播事件，跟随这些事件的是在新宿主中的传播，即使病毒在新宿主中并不能长期持续存在。

图3.3 RABV进化史中潜在事件的时间轴。

图中显示了关键事件的假设顺序，但时间尺度只是近似的，有些事件可能发生在很长的时间间隔内。

图中英文的中文翻译：

Chiroptera evolve，翼手目动物的进化

Dogs domesticated，狗被驯化

Humans arrive to the Americas，人类来到美洲

Europeans colonize Americas，欧洲人殖民美洲

Years before present，距今多少年（M,百万； K，千）

Events ，事件

Host shift of non-RABV lyssavirus triggers evolution of RABV in Oceania，非RABV丽沙病毒的宿主转移引发大洋洲RABV的进化

Host shift to Old World carnivores，向旧大陆食肉动物的宿主转移

Continental separation isolates RABV in American bats，大陆的分离导致美洲蝙蝠RABV病毒的隔离

RABV ancestor goes extinct from Old World bats，RABV病毒的祖先在旧大陆蝙蝠中已经灭绝

Global spread of dog RABV and establishment of additional wild- carnivore strains，犬RABV的全球传播和其他野生食肉动物毒株的建立

* recombination?　*重组?

Establishment of American indigenous wild-carnivore RABV，美洲本土野生食肉动物RABV的建立

图3.4历史上的宿主转移可能无法从当代数据中准确推断出来。

左图：实际发生的宿主转移。发生了两次宿主转移(用星号表示)，病毒从物种A跳到物种B，从物种B跳到物种C。

右图：根据当代数据推断的宿主转移。在第二次宿主转移之后，物种B的病毒谱系灭绝了。因此，来自物种 A和C的两个现存谱系的病毒序列数据提供了一个不完整的图解，表明病毒是直接从物种 A跳到C。

此外，从物种A到物种B的宿主转移过后发生的所有遗传变化(橙色显示)也将被错误地归因于推断的从物种A到物种C的宿主转移。

（未完待续）

相关链接：

Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编，《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT（狂犬病的科学基础和管控）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版（第４版）共有22章，732页，由Elsevier Inc.旗下的学术出版社（Academic Press）出版。