单细胞免疫组（TCR/BCR）测序

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单细胞免疫组分析可以通过分析决定B细胞受体（BCR）或T细胞受体（TCR）多样性的互补决定区（CDR区），全面评估免疫系统的多样性，深入挖掘免疫组库与疾病的关系。

http://www.cloud-seq.com.cn/product-item-103.html 

技术简介：
将预先制备好的单细胞悬液在Rhapsody平台上进行单细胞分离捕获后，进行反转录和模板转换。经过变性、杂交、Klenow扩增，外切酶处理后进行第一轮PCR，之后根据实验多组学分析需求，分别进行TCR PCR、BCR PCR、Target mRNA PCR、Sample tag PCR和AbSeq PCR。文库制备完成后，进行测序及后续数据分析。

技术优势：
1）支持多样本检测，提升分析效率，同时降低单样本分析成本；
2）可以同时进行蛋白质检测，实现靶向mRNA+蛋白质+VDJ的单细胞多组学研究

应用方向：

免疫组库在肿瘤研究、移植和免疫重建、自身免疫性疾病、感染性疾病、抗体开发、用药及疫苗评估等多个方面均有重要的应用价值。

样本准备：
细胞数目：>1-2x10⁵个；
细胞活率：>80%；
细胞直径：<30μm；
细胞悬液：细胞悬液中应避免存在细胞成团、细胞碎片或其它杂质等现象。同时避免溶液中残留核酸、EDTA、Dnase I等可能影响后续实验的物种。

案例解析：

案例：不同滑膜组织巨噬细胞亚群调节类风湿性关节炎的炎症和缓解

原文： Distinct synovial tissue macrophage subsets regulate inflammation and remission in rheumatoid arthritis
期刊： Nature Medicine(2020) 影响因子：36.1
类风湿关节炎(RA)无药物缓解的免疫调节机制尚不清楚。假设认为滑膜组织巨噬细胞(STM)有助于关节稳态。作者使用单细胞转录组学对32000名STM进行分析，并在早期RA、治疗期RA和缓解期RA患者中确定了表型变化。每个临床状态的特征在四个不同的STM亚群中9个离散表型聚集的不同频率，这些亚群具有不同的稳态。该细胞图谱，结合滑膜活检荧光激活细胞分类的深层表型、空间和功能分析，显示了两个STM亚群(MerTKposTREM2high和MerTKposLYVE1pos)具有独特缓解转录组特征富集在炎症的负调控因子。这些STM是炎症溶解脂质介质的有效生产者，并在体外诱导滑膜成纤维细胞的修复反应。MerTKpos STMs缓解的低比例与停止治疗后疾病暴发的风险增加相关。因此，MerTKpos STM亚群的治疗调节可能是RA的潜在治疗策略。