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实验目的:从粪便中分离提取外泌体。
实验原料:粪便(新鲜或者4℃存储样品)
试剂耗材:
1,外泌体提取试剂盒(Umibio,UR52121)
2,针式过滤器(0.45μm)
3,PBS缓冲液(2℃-8℃预冷)
实验步骤:
一、 样品预处理
(1)粪便样本收集在无菌的宽口容器中,立即使用(收集样品后置于冰上)或冷藏(4°C)。
(2)使用勺子将3g的粪便转移到预先称重的离心管中,向试管中加入预冷(2℃-8℃)的30毫升无内毒素PBS(按照每1g粪便对应10毫升PBS加入)。
(3)通过涡旋振荡器充分混匀粪便样本5分钟。在此步骤中,将高速离心机和离心转子冷却至4°C。
(4)将混匀粪便的离心管放入高速离心机中,在4°C,8000g的温度下离心10分钟。
(5)收集滤过液,使用移液器将其转移到新的离心管中,在4°C,10000g的温度下离心10分钟。
(6)收集滤过液,通过针式过滤器(0.45μm)进行过滤,收集滤过液。
二、 提取外泌体
(1)滤过液预处理:在去除杂质的离心滤过液中加入Exosome Concentration Solution(ECS试剂),具体的加入剂量如下:(其他剂量请根据表中的试剂用量等比例换算)
样品名称 | 样品剂量 | 加入ECS剂量 |
粪便滤过液 | 20 mL | 5 mL |
(2)溶液混合:加入ECS试剂后将离心管盖紧,通过涡旋振荡器混匀1 min,再放置于4℃静置至少2 h;(增加静置时间可提高外泌体得率,但静置时间不可超过24h)
(3)沉淀外泌体:取出装有混合液的离心管于4℃以10000 g离心60 min,弃上清,沉淀中富含外泌体颗粒;(注:尽可能吸净滤过液)
(4)外泌体重悬:取1×PBS均匀吹打离心沉淀物(具体加入剂量如下表),待其溶解后,将重悬液转移至新的1.5 mL离心管中;
样品体积 | 加入PBS剂量 |
20 mL | 0.2 mL |
注:其他剂量请根据表中的试剂用量等比例换算
(5)收获外泌体颗粒:将含有重悬液的1.5 mL离心管于4℃以12000 g离心2 min,保留滤过液,该滤过液中富含外泌体颗粒。(注:若沉淀较多,可12000 g /2min离心多次至无明显沉淀,每次取离心滤过液)
三、 纯化外泌体
(1)纯化外泌体:将收获的外泌体颗粒粗品转入Exosome Purification Filter(EPF柱)上室中,于4℃以3000 g离心10 min,离心后收集EPF柱管底的液体,此液体即为纯化后的外泌体颗粒;(注:EPF柱不可重复使用)
(2)外泌体的保存:纯化后的外泌体以50-100 μL进行分装保存于-80℃低温冰箱中,以备后继实验使用。
参考文献:
1, Isolation and Characterization of Exosomes from Mouse Feces, Bio Protoc. 2020 Apr 20;10(8):e3584. doi: 10.21769/bioprotoc.3584.
2, High-fat diet-induced upregulation of exosomal phosphatidylcholine contributes to insulin resistance. Nat Commun. 2021 Jan 11;12(1):213. doi: 10.1038/s41467-020-20500-w.
3, Sepsis-Like Systemic Inflammation Induced by Nano-Sized Extracellular Vesicles From Feces. Front Microbiol. 2018 Aug 7;9:1735. doi: 10.3389/fmicb.2018.01735. eCollection 2018.
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