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染色体dup15q是指15q11.2-q13.1出现3个或者4个拷贝,如果来自母源的情况下是致病性的,外显率很高,癫痫、自闭症、智力障碍大概少不了会出现,在之前《母源CNV中的一个特殊致病性位置》文里曾对该区域在NIPT怀疑母源CNV时指出一定要进行产前诊断,并且如果胎儿诊断携带了时不能以为母源CNV就认为可能是低风险的,恰恰是高风险的特殊情况。最年来看到了好几例NIPT的高风险病例,个别的诊断策略选择上值得斟酌,在 此进行一些讨论。
先看具体的病例情况:
1.无创补充报告:15q11.2-q13.3出现重复,这类异常普通无创其实同样能发现意外的检测结果,但PLUS发现了一般来说更有可能报告出来。这里面产前检查里说建议采用CNV-seq或SNP-array进行诊断,然而这个位置的异常采用CNV-seq可能会面临一些问题,后面再讨论。
2.诊断结果:可以看到和无创提示一致,无创报此处的CNV得到了确诊,并且在说明里提示是4个拷贝的重复。结果说明里感觉有些让人不能理解的,比如第1点说致病性的,之前也列举了许多表现,但是后面又说和临床症状关系未知;第二点说可能为父母遗传性的,而4拷贝的情况绝大部分不太可能来自父母携带者的情况,因为3拷贝还可能没啥症状,4拷贝即使父源的情况很大概率也有异常表现了,另外检查父母来源的时候,因为第一次的是CNV-seq,此时还是用CNV-seq就有可能无法判断这个异常为新发的情况下多出来的拷贝数是来源于父亲还是母亲。
3.核型结果:核型提示正常,没有报告15号染色体异常,尽管图上看15q是有点不太正常的感觉,可能是这种异常对核型的阅片人员来说识别起来有困难吧。
结合核型和CNV-seq的结果来看,可能为间隙15q11.2-q13.1三体,导致15q11.2-q13.1四体。如下图左边A所示。
遇到这样的情况是否有必要验证父母的CNV呢?验证的话能否选择CNV-seq呢?从鉴定多出的染色体拷贝来源父母的哪一方的角度来看,选择CNV-seq显然存在问题,家系CNV-seq目前的技术只能知道异常是否属于遗传的,而这个异常很大概率不是遗传的,四拷贝不论谁携带都很可能出问题,而最需要搞清楚多出的拷贝是哪一方的这个问题却又难以回答,在上一篇文章中介绍了用家系CNV-seq分析UPD的进展,但是对这种片段重复的情况还不太确定可以获得显著的区分信号,因而家系CNV-seq验证的价值可能非常有限。所以遇到这种情况,用家系CMA验证是目前来看更为合理的选择。但一开始用CNV-seq做羊水的情况下此时再上家系3个样本的CMA检测估计就要上万的费用了,显然性价比很低,有条件可以用甲基化PCR诊断【1】,如下图所示,性价比十分高,但是大多数产前诊断中心估计没遇到过这种病例,没有储备相关的技术,还需要能有幸找到合适的机构来做。
1. Askree SH, Dharamrup S, Hjelm LN, Coffee B. Parent-of-origin testing for 15q11-q13 gains by quantitative DNA methylation analysis. J Mol Diagn. 2012;14(3):192-198.
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