目前最新版为Cytoscape_3_8_2，安装如下：

按照要求Cytoscape_3_8_2_windows_64bit.exe必须安装java8。先从java官网下载到最新的jre-8u291-windows-x64.exe。安装完java后，再直接运行Cytoscape安装时会报错如下：

虽然用Locate将其定位到java安装目录

但是依然会有报错：

后来发现Cytoscape官网提供了一下安装环境检测工具：

进入https://cytoscape.org/troubleshooting.html

右键点击Download for Windows，并保存，这个文件默认保存名为windows.bat。双击windows.bat，运行如下：

它表示需要安装java version 11，这个是OpenJDK的版本。因此按照它的提示，进入提供的网址：https://adoptopenjdk.net/?variant=openjdk11

点击latest release下载，并安装，一路确认即可。默认安装路径为

C:\Program Files\AdoptOpenJDK

安装openjdk11后，再安装Cytoscape。这时候因为没有JAVA_HOME，还是会出现

但是不要紧，这次点击Locate，指点JRE的路径为：

C:\Program Files\AdoptOpenJDK\jdk-11.0.11.9-hotspot\bin\java.exe

指定完就可以正常安装Cytoscape了。安装完打开，界面如下