Augustus是基因组注释的软件，也是凯撒继承人屋大维的名字，顿感高级。

Augustus的从头预测理念是，寻找与目标注释基因组同源或者近源的物种进行trainning，得到HMM参数，然后利用HMM参数对我们自己的参考基因组进行从头预测注释。

这里的trainning是学习的意思，让Augustus软件学习近源或者本物种的参考基因组的基因结构参数，利用该参数对目标参考基因组进行从头预测注释。

因此，从这里看，Augustus的流程主要分为三个部分：

第一：从数据库下载已知的参考基因组。

第二，对已知参考基因组进行tranning。

第三，利用trainning完的HMM参数，对我们的参考基因组进行从头注释。