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本绘图方法基于R语言实战(R in action),基于图形初阶的方法,使用R软件自带的plot()函数绘图,基础的分为5步
attach(data)#对data添加路径索引:attach(data)后就可以引用直接引用data中的元素了
plot(x,y)#绘图
abline(lm(y~x))#添加拟合曲线
title("图形标题")#添加标题
detach(data)#撤销attach建立的路径索引
alpha<-read.csv("Alpha.csv",row.names=1)
attach(alpha)
#画点图(shannon指数随着深度的变化趋势)
plot(shannon~depth,ylim=c(6.0,9.5),xaxt="n",pch=16,col="steelblue")
#添加x轴坐标:axis(side,at=,labels=)
#side:一个整数表示在图形的那边绘制坐标轴(1=下,2=左,3=上,4=右)
#at:一个数值型向量,表示绘制刻度线的位置
#labels:一个字符型向量,表示置于刻度线旁边的文字标签
axis(1,at=depth,labels=depth)
#lm()是R语言中经常用到的函数,用来拟合回归模型。它是拟合线性模型最基本的函数。
fit<-lm(shannon~depth,data=alpha) #拟合
summary(fit) #查看拟合结果
abline(lm(shannon~depth)) #添加拟合线
detach(alpha)
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