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国家基因组科学数据中心

已有 3535 次阅读 2020-1-23 11:03 |个人分类:文章转载|系统分类:科研笔记| NCBI |文章来源:转载

任务使命

国家基因组科学数据中心于2019年6月经科技部、财政部通知公布,由中国科学院北京基因组研究所作为依托单位,联合中国科学院生物物理研究所和中国科学院上海营养与健康研究所共同建设。中心针对我国基因组学数据“存管用”的实际需求以及“数据孤岛”、“数据主权”的重大问题,围绕人、动物、植物、微生物等基因组数据,重点开展数据库体系及数据资源建设,开展数据服务、系统运维、技术研发、数据挖掘等系列工作,建成有国际影响力的基因组科学数据中心,促进科学数据开放共享,保障科学数据安全可控,支撑国家科技创新和经济社会发展。

中心目前拥有90余人的工作团队,具备5000个以上CPU计算核心及总容量超过8PB数据存储资源,已经开发形成一系列的多组学数据库系统,中心主要致力于以下三方面的工作:

  • 围绕中国人群普惠健康的精准医学相关组学信息资源,完善建立中国人群基因组遗传变异图谱,形成中国人群精准医学信息库

  • 基于高通量测序的海量原始组学数据资源,建立符合国际标准的原始组学数据归档库,形成中国原始组学数据的共享平台

  • 围绕国家重要战略生物资源,建立海量组学数据的整合、挖掘与应用体系,形成综合性的多组学数据库系统。

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关于冠状病毒

冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。某些冠状病毒会感染人类并引起疾病,比如中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS),其症状可从普通感冒到重症肺部感染。此次在武汉首先发现的冠状病毒是一种先前尚未在人类中发现的病毒株系,被WHO命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。

NCBI的病毒分类工具PASC将2019-nCov分类为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒种(Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus),该种还包含2003年爆发的SARS病毒,两者基因组序列相似度为80%。在已发布的数据中,2019-nCoV与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,为88%。


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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