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Win10
空间:10G以上
耗时:根据原始文件大小,约sample/4h,可以使用多核加速运行
1,载入数据,注意设置每个样品的Experiment,样品名
2,载入蛋白质fasta文件
注意把Label free quantification标签中的LFQ导出选中
3,运行
漫长等待后,结果文件见combined/txt/proteinGroups.txt,其中LFQ即为所需的信息。
4,标准化,差异
得到LFQ后,使用quantile标准化,使用ttest等按照fold change和p(fdr)筛选差异
5,功能分析
GO,Pathway,PPI等
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GMT+8, 2024-10-20 01:06
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