pujvzi的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/pujvzi

博文

SRA数据的下载

已有 2975 次阅读 2018-11-6 16:38 |个人分类:生信|系统分类:科研笔记| SRA, NCBI, 数据下载

 

SRA数据的下载

 

(1)SRA数据链接

    https://ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/

    里面有三个目录,SRR,DRR,ERR。

    网页上找到你想要下载的SRA数据

    比如说

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=SRP152380

    里面有

    SRR8113362

    SRR8113363

    SRR8113364

    SRR8113365等信息

那么即可知道下载链接为

https://ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR811/SRR8113362/SRR8113362.sra

 

将链接复制到FTP下载软件中即可我用的是free download manager),或者迅雷中

 

 

(2)当然也可以用SRA toolkit。

(3)ascp需要向SRA申请一个key。 




https://blog.sciencenet.cn/blog-331314-1144858.html

上一篇:胚胎期13.5小鼠生殖脊(全组织)的免疫荧光标记
下一篇:卵母细胞染色体铺片(低渗法与爆炸法联用)
收藏 IP: 218.19.139.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-6-2 02:51

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部