MSI/MMR检测可用于有效地评估PD-1单抗免疫治疗在癌细胞治疗中的效益。

MSI（Microsatellite instability，微卫星不稳定性），是指由于在DNA复制时插入或缺失突变引起的微卫星序列长度改变的现象，常由错配修复(MMR)功能缺陷引起。MSI现象于1993年被Jacobs等人在结直肠癌中首次发现，与癌症发生有关，可用于癌症检测。

微卫星序列（MS），又称简单重复序列（SSR），是一些短而重复的DNA序列，一般由1-6个核苷酸组成，串联重复排列，常见类型为双碱基CA／GA或单碱基A／T等，存在于内含子等非编码区，多态性分布于整个基因组，个体差异大。

MMR（DNA mismatch repair，DNA错配修复），这种DNA修复机制能够准确地识别及修复在DNA复制或重组过程中产生的碱基错配，小范围的碱基缺失或插入，对维持基因组稳定性，遗传后代的精确性有着重要的作用。

MSI常由MMR基因突变及功能缺失导致。因此，在检测癌细胞中MSI时，既可以直接检测MSI序列变化，也可以通过检测MMR基因缺失来确定是否发生MSI。两种检测一致性很好，MSI检测发现的结直肠癌中近93%也适用于MMR基因缺陷检测。不同的是技术手段，MMR基因缺陷检测常依赖于免疫组化（蛋白水平），而MSI检测一般依赖于分子手段，PCR检测(DNA水平)。

MMR通过IHC（免疫组化）检测的目标蛋白是MLH1、MSH2、MSH6和PMS2。

免疫组化检测的优势是可以直接鉴定出导致MSI发生的MMR缺陷基因，但是，约5%-11%的MSI发生并不会出现MMR蛋白的缺陷。某些MMR蛋白错义突变，会损失MMR功能，但能被抗体检测识别，因此这是分子检测的优势，目前常用的检测MSI的方法是分子检测结合免疫组化检测。

MSI状态可通过聚合酶链式反应（PCR）方法检测。通过检测6个单核苷酸位点（NR-27、NR-24、NR-21、BAT-25、BAT-26、MONO-27）以及 PentaC 和 PentaD 2个对照位点、1个Amel性别位点（用以识别潜在的样品混杂及污染）共检测9个位点来保证检测结果的准确性。

实验流程：

通常MSI的检测样品包含一对肿瘤组织和正常组织（通常是血液或癌旁组织），通过提取样本DNA→多重荧光PCR扩增→毛细管电泳检测→Genemapper软件分析等一系列流程后，将得到肿瘤组织和癌旁组织（对照组织）的MSI分型图谱。