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常规测序序列处理(Sequencher 4.5)

已有 6274 次阅读 2017-11-24 15:35 |个人分类:软件使用|系统分类:科研笔记| 常规测序


常规测序序列处理

Sequencher 4.5日常使用流程记录

COI基因片段

平时常规测序时得到的序列,需要简单处理一下,通常使用Sequencher 4.5进行操作。

流程如下:

Windows中打开Sequencher 4.5→直接导入双向后缀为abi的文件(共两个)→点击assembly automatically→双击小图标→点击base→点击show chromatograms→检查错误

①检查是否标有“·”

②有的话,改成质量较好的碱基位点:a.上下对应位点颜色不一样的,改成浅色的。

b.上下位点一样的,按照峰图更高的改。

改好后,输出格式改为fasta。保存。自行修改后缀。







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