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超(晶)胞<——>原胞

已有 23610 次阅读 2017-8-22 21:18 |个人分类:VASP计算|系统分类:科研笔记| amp, 原胞转化


超(晶)胞&原胞转化方法:


1. Vesta(原——>超)

    用vesta打开1x1x1单胞,然后点Edit菜单Edit Data--Unit Cell,然后点Option选项,将Rotation matrix P第三行由(0 0 1)改为(0 0 2),点ok,再点两次yes,然后在structure parameters界面右下角点remove duplicate atoms,然后再export data,选择vasp格式,即输出标准格式的POSCAR文件。


2. MS(超——>原)

     bulid-symmetry-primitive cell(若不能选,已是原胞)

   注:只结构优化的话,primitive cell之后不需要make P1,本身已经是P1了。若考虑到参杂具体分析。

    (原胞——>晶胞)

     CONTCAR——>VESTA——>.cif——>MS——>build-symmetry-find symmetry(出现方格中会显示晶格常数)——>(实验结果对比)


3. phonopy --symmetry POSCAR  (超——>原)

    PPOSCAR is primitive cell; BPOSCAR is Bravais lattice.

 #!!! 直接vi模式修改PPOSCAR  (注意引入中文空格)

     注:天河需调用phonopy/1.9.7





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