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超(晶)胞&原胞转化方法:
1. Vesta(原——>超)
用vesta打开1x1x1单胞,然后点Edit菜单Edit Data--Unit Cell,然后点Option选项,将Rotation matrix P第三行由(0 0 1)改为(0 0 2),点ok,再点两次yes,然后在structure parameters界面右下角点remove duplicate atoms,然后再export data,选择vasp格式,即输出标准格式的POSCAR文件。
2. MS(超——>原)
bulid-symmetry-primitive cell(若不能选,已是原胞)
注:只结构优化的话,primitive cell之后不需要make P1,本身已经是P1了。若考虑到参杂具体分析。
(原胞——>晶胞)
CONTCAR——>VESTA——>.cif——>MS——>build-symmetry-find symmetry(出现方格中会显示晶格常数)——>(实验结果对比)
3. phonopy --symmetry POSCAR (超——>原)
PPOSCAR is primitive cell; BPOSCAR is Bravais lattice.
#!!! 直接vi模式修改PPOSCAR (注意引入中文空格)
注:天河需调用phonopy/1.9.7
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