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基于Cpf1一次实现多基因编辑的技术

已有 4144 次阅读 2017-2-8 11:42 |系统分类:科普集锦| Cpf1

   昨天去大神实验室网页(http://zlab.mit.edu/team.html)转的时候发现还是上次那个样子没有一点更新,第一反应就是这不科学啊,Yinqing Li的单神经元转录组的文章(Div-Seq)在去年就在Science上出来了,然后就PubMed检索了一下,发现了这篇文章。说起来也是很简单,Cpf1不同于Cas9之处就是它自己可以根据需要将crRNA切割并形成有效的复合体(图1)。也就是说理论上只需

图1来源:http://www.nature.com/nbt/journal/v35/n1/full/nbt.3737.html

将多个crRNA线性排列在一个启动子之后,就可以实现用一个质粒完成多个基因的编辑了(图2a)。然后他们就设计了单个crRNA以及不同长度的串联靶标序列和Cpf1识别序列的组合来检测其对多基因的编辑效果,结果显示多个串联crRNA表达后对每个基因的编辑效率都蛮高(图2b),随后在小鼠大脑内实现了三敲之后整篇文章的重点结束。


图2来源:http://www.nature.com/nbt/journal/v35/n1/full/nbt.3737.html


   通过这篇文章咱又学习了一点:Cpf1具有多基因编辑的能力。这和之前咱介绍的借用tRNA处理机制实现多基因编辑的方法(戳此查看)相比而言,需要的序列更短了,对于全基因组范围内高通量基因编辑的实践意义也是非同小可。为啥?因为需要的crRNA长度更短呗,更容易合成和操作,不同crRNA之间发生重组的概率也得以降低。


更多精彩内容请关注生物技术的行星



参考文献:Multiplex gene editing by CRISPR–Cpf1 using a single crRNA array




https://blog.sciencenet.cn/blog-823394-1032311.html

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