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(2) 完整的病毒:Bacteriophage phiX174, Poliovirus and Rhinovirus, Dengue Virus, Parvoviruses, Adenovirus, & Tobacco Mosaic Virus
Bacteriophage phiX174(噬菌体phiX174)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2000_2
-数据库中第一万个结构 1cd3 ,420 chains、超过五十万个原子
-二十面体 (icosahedron) 对称性:7 × 60
-不包括DNA结构
Poliovirus(脊髓灰质炎病毒)and Rhinovirus(鼻病毒)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2001_8
-属细小核糖核酸病毒 (Picornavirus),还包括口蹄疫病毒
-脊髓灰质炎病毒:仅3种型,胃肠型流感症状,一次感染终身免疫,约1%概率入侵神经系统致病
[图] 脊髓灰质炎病毒结合受体(入侵)1dgi ;结合抗体片段(被识别)1rvf。
-鼻病毒:多型、可反复感染,简单、生命力强。很多与药物分子结合的结构可得
Dengue Virus(登革病毒)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2008_7
-RNA病毒,编码10个蛋白(3结构蛋白)
-最外为3个结构蛋白 × 180 1k4r
-进入细胞后遇溶酶体酸性环境,改变四级结构 1ok8 ,尖端疏水残基插入溶酶体膜完成RNA释放
-有四型,难发展疫苗
-非结构蛋白包括甲基转移酶、聚合酶、蛋白水解酶、解旋酶
Parvoviruses(细小病毒)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2010_5
-可发生病毒进化 (viral emergence),1970年代末期猫瘟病毒(feline panleukopenia virus)1fpv 发生几个点突变,可以感染狗 2cas [图]
-进攻转铁蛋白 (transferrin) 受体
-人细小病毒 1s58 可引起5号病
-比核糖体稍大,DNA病毒
Adenovirus(腺病毒)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2010_12
-对免疫系统正常的成人、婴儿无害,用于治疗基因疾病、癌症和运输疫苗
-结构复杂:240个三条相同链组成的六边形、12个5条相同链组成五边形在二十面体顶点、顶点伸出3条相同链组成的长纤维
-纤维与细胞表面蛋白结合、内吞作用进入细胞、与整合素结合囊泡破裂
-由于会被免疫系统清除,无法做长期治疗。
Tobacco Mosaic Virus(烟草花叶病毒)http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2009_1
-第一个发现(分离得到)的病毒
-螺旋状,编码4个蛋白(2 DNA复制、1 RNA运输、1衣壳)的RNA被蛋白质包裹,非常稳定
-在细胞内衣壳必须除去才能发生感染:衣壳蛋白的酸性氨基酸在细胞内无钙离子环境下相互排斥,排列松动
-病毒组装过程复杂:两层每层17个衣壳蛋白的螺旋首先形成,RNA特定序列结合其上,变为每层16又1/3个衣壳蛋白的螺旋,更多衣壳蛋白再结合上去。可确保只有病毒RNA能够结合
-RNA与衣壳蛋白的结合:3个碱基结合1个蛋白
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