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已有 7706 次阅读 2015-12-5 23:08 |系统分类:科研笔记
方法一
rdkit
smiles2sdf.py.zip
方法二 canvas(推荐)
导入.smi文件,导出sdf文件
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smiles 中没有坐标信息,导出的结构是2D的可通过ligprep等工具转成3D的,转换过程注意手型信息。
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