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GLIDE中的box是双box模型。
如果希望小分子在定义的口袋中到处乱跑,除了把box设置大了,还需要设置INNEBOX,
INNERBOX 限定了小分子的中心只能落在INNERBOX,默认是10,10,10。
OUTTERBOX 限制了小分子只能在这个盒子里面
在图形界面的Advance setting中
另外需要注意的是
图形界面中设置的口袋只能是正方体
在命令行中,可以设置口袋的长宽高。
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