在终端中输入：echo $GAUSS_SCRDIR看看是空的还是有路径
如果是空的，那么就说明你没设置这个变量，这样的话临时文件会写在和输入输出文件相同的目录下。如果你设置了这个变量，那么请保证你设置的这个目录是存在的并且你拥有读和写的权限。最简单的办法就是将这个目录设置为/tmp
比如，在.bashrc里面这样写：
export GAUSS_SCRDIR=/tmp

也可以在gjf 中设置

根目录  高斯

建议新手

把g09 安装到用户目录下/home/xxx/g09

然后设置下PATH基本就可以用了

一定要对整个g09文件夹 赋予权限

chmod -R 770 g09

注意这里使用了-R 进行了递归 赋予权限

在非用户目录下安装好像有点困难。

/home/xxx/software/g09

有机会的时候，我再试试，看看需要修改哪些配置文件。

http://hzh.me/2011/10/28/linux%E4%B8%8B%E5%AE%89%E8%A3%85gaussian09/

http://hzh.me/2011/10/28/linux%E4%B8%8B%E5%AE%89%E8%A3%85gaussian09/

现在贴出我的配置

export GAUSS_EXEDIR=/home/xxx/g09

export G09ROOT=/home/xxxx/g09

export GAUSS_SCRDIR=/tmp

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/$G09ROOT

export PATH=$PATH:/home/xxxxg09