autodataming的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/autodataming

博文

如何下载cas已经知道的化合物的结构

已有 8197 次阅读 2013-12-18 16:11 |系统分类:科研笔记

之前写过一个脚本,通过pubchem来下载分子sdf文件,

由于有些分子pubchem没有收录进去,

下载不到。

我又想到了另一种方法:

首先通过cas号,得到化合物的IUPAC命名

然后借助于chemdraw的一个模块讲化学名转成结构

structure--->convert Name to structurel;

 

当然这里所有的都是可以批量进行的。

一方面chemDraw可以通过按键精灵来处理,

另一方面chemDraw也支持python脚本的接口。



https://blog.sciencenet.cn/blog-950202-750831.html

上一篇:中药化合物库的下载
下一篇:批量下载pdb
收藏 IP: 202.127.19.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-12-22 21:38

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部