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PYMOLWIKI GAP SELECT
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Atoms whose VDW radii are separated from the VDW radii of S1 by a minimum of 1.2 Angstroms.
| gap | > X | center+vdw |
selct xx, name ca and lig gap 1.2
lig----vdw+1.2 +vdw---------ca
离lig的距离超过 范德化半径之和+1.2 的距离的CA
https://blog.sciencenet.cn/blog-950202-1096908.html
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