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1 盐桥 (salt bridge);
盐桥的距离大概是小于6埃。4A 就比较强了。
3kcal /5kcal/
In detail, SBs are treated as a contact between
NH/NZ in ARG/LYS residues and OE*/OD* in ASP/GLU AA。
K72---E91,PDB id: 1ATP;Fig 3
K带有正电荷,E带有负电荷。
盐键又称盐桥或离子键, 它是正电荷与负电荷之间的一种静电相互作用。
REF: R. Roskoski Jr. / Pharmacological Research 100 (2015) 1–23
2. Hydrogen bond
氢键能量范围跨度也很大,0.2-40 Kcal/mol.角度一般大于90或者110度,距离d一般小于3或者3.2A。
X-H...A
O-H...O
距离d(HA) 1.2-2.2+/3.2
距离D(XA) 2.2-3.2+
角度90/110-180
氢键和卤键类似,受体可以是电负性原子或者PI 体系。PI的中心和node 都可以作为氢键的受体。
Angew Chem Int Ed Engl. 2002 Jan 4;41(1):49-76.
3. Halogen bond
4. PI-PI
苯环中心距离小于6A,有各种构象。
平行 T L形状
4. PI...X
5. 双硫键 小于3A
#### 参考
https://chemistry.stackexchange.com/questions/60113/salt-bridge-vs-hydrogen-bond
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