推荐大家使用64位的系统

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PyMOL版本分为3种，商业版，轮子版，源代码版。

商业版的优缺点

安装简单，不需要单独的python解释器，自身封装了python解释器。

缺点：在32bit电脑上测试，其pip命令无法使用，import pip; pip.main(['install','xxx'])

在32位win7电脑上测试发现，安装商业版本Pymol，就无法同时安装多个版本的Pymol。

不是免费的。

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轮子版的优缺点

优点：安装简单，安装前需要先安装python。到uci ( )网站下载对应的轮子。

http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol，

具体安装顺序，参考pymolwiki  windows install pymol

和自身的编译器无缝集成，共享pip， 可以通过轮子法，安装scipy.

缺点： 版本有限，比如Pymol1.8 版本，就不能使用python2 的解释器。

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源代码版

优点： 自由

缺点： 编译复杂，不建议使用。

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目前我的电脑是32位，python27，为了安装多个版本的pymol，

我先安装了轮子版的pymol1.7，然后再安装其他版本。

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如果安装numpy+mkl 出现问题，IOError: [Errno 13] Permission denied,  libiomp5md.dll

另一种方式是将.whl后缀改名为zip，解压，将解压后的numpy，numpy-1.11.0.dist-info两个文件夹放入Python/Lib/site-packages中即可。

有了numpy和MKL，接下来就可以以同样的方式安装SciPy和statsmodels，注意：安装顺序为numpy+mkl，SciPy，statsmodels。

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