douglas086的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/douglas086

博文

肠道菌群及其微生态学-胃肠道每个区域的常见分类群

已有 1857 次阅读 2023-12-26 15:40 |个人分类:他山之玉|系统分类:论文交流


肠道菌群及其微生态学

这种新的肠道微生物学方法提供了跨越时间和空间尺度的重要见解,从发现微生物群的粘液包裹到整个肠道细菌物种的量化。在这篇综述中,强调了通过观察和量化多个尺度的异质性而实现的围绕肠道造影的新兴知识。

在生物生态系统中,空间定位是我们如何理解生态群落内相互作用的核心,因为邻近的物种更有可能发展关系并影响彼此的功能。生物地理学是研究生物和环境的相互作用如何影响生态系统中的物种分布和多样性的学科。就像森林或其他宏观生态系统一样,肠道远非物种和环境的同质混合物。在从整个器官到单个细胞的多个尺度上,胃肠道的不同区域和微环境具有不同的物理和生化条件,这些条件驱动着胃肠道内微生物群落的组成和功能。沿着肠道的纵轴和横轴,物理和化学参数的梯度,如pH值、氧浓度、流动和消化速率、抗菌肽(AMP)、粘液类型和密度、营养物质的可用性等,与微生物群特定成员的生长和丰度相关。由饮食,药物和其他因素驱动的物理肠道环境的变化伴随着微生物群组成的变化。因此,特定的分类群可能是胃肠道条件改变的生物标志物。

肠道中微生物景观的复杂空间组织和异质性。物理肠道环境中的空间差异,从器官水平(10-100 cm)到单个微生物群落水平(数十至数百微米)的尺度范围内,驱动了使用粪便或其他混合良好的样品评估微生物群无法捕获的异质微生物行为。生物地理学特征,如肠道的细菌组织和物理参数,从整个肠道(10-100 cm,由肠道隔室组织)到宿主-细菌界面(10-100 μm),最后到微生物群落(数十至数百微米),在多个尺度上变化。环境参数和细菌组成沿着肠道纵轴变化。列出了胃肠道每个区域的常见分类群。


粘液、氧气、抗菌肽和其他免疫因子驱动上皮附近的细菌定植和组织化。在小肠中,隐窝内有分泌抗菌肽的潘氏细胞,这些细胞在很大程度上阻止细菌在片状粘液层和上皮表面定植。分节丝状细菌(SFB)粘附在上皮细胞上,并且在派尔集合淋巴结处的细菌接触促进了微生物群的免疫取样。在结肠中,致密的内粘液层排除上皮处的细菌定植。松散的外粘液层由细菌(包括粘液溶解细菌)定殖,但也宿主噬菌体和调节细菌定殖和清除的分泌的免疫因子的积累。这一地区的地穴可以被选定的物种殖民。在管腔中,食物颗粒和碎片充当细菌群落的附着位点。 

 

在健康条件下,内粘液层在很大程度上防止细菌接触宿主上皮(左图)。在炎症性肠病患者中观察到的或由几种环境和饮食干扰引起的变薄和变弱的粘液层导致细菌与宿主持续接触,从而引发炎症和哨兵杯状细胞死亡(右图)。这个过程反过来又加剧了粘液层的持续变薄。

[1] G. McCallum, C. Tropini, The gut microbiota and its biogeography, Nature Reviews Microbiology  (2023).

  • DOIhttps://doi.org/10.1038/s41579-023-00969-0




https://blog.sciencenet.cn/blog-89570-1415426.html

上一篇:开环佛波醇衍生物及其抗HIV-1活性
下一篇:如梦令 毕业季
收藏 IP: 42.244.62.*| 热度|

3 郑永军 农绍庄 杨正瓴

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (1 个评论)

IP: 59.68.77.*   | 璧� 璧� +1 [7]鐢樻案瓒�   2009-3-30 22:41
1991骞达紝缇庡浗鍝堜經澶у涓庨夯鐪佺悊宸ュ闄㈠彂璧蜂竴骞翠竴搴︾殑鈥滄悶绗戣璐濆皵濂栤€濓紙the Ig Nobel Prizes锛夈€傛墍鏈夎幏濂栫殑鐮旂┒閮界湡瀹炲瓨鍦紝骞朵笖閮藉湪鏈夊▉鏈涚殑绉戝鍙婂尰瀛︽潅蹇椾笂鍙戣〃杩囷紝浣嗘悶绗戣璐濆皵濂栫殑鑾峰緱鑰呬笉浠呬笉浼氬洜鑾峰鑰屽緱鍒板叕璁わ紝骞朵笖涔熶笉澶ф湁鍙兘鍥犺鍙戞槑鐮旂┒鑰屼娇绉戝鍜屽尰瀛﹀嚭鐜板法澶х殑鍙橀潻鎴栫獊鐮淬€�1992骞达紝鈥滄悶绗戣璐濆皵濂栤€濇枃瀛﹀琚巿浜堣帿鏂鏈夋満鍏冪礌娣峰悎鐗╃爺绌堕櫌鐨勫挨鍒┞稵路鏂壒鎷夌澶紙孝.小褌褉邪泻芯胁锛夛紝浠栧湪1981骞磋嚦1990骞存湡闂村湪鏈夊▉鏈涚殑鏉傚織涓婂叡鍙戣〃948绡囩瀛︾爺绌惰鏂囷紝骞冲潎姣�3.9澶╁彂琛ㄤ竴绡囥€傚彂琛ㄧ殑鏂囩珷鏄澶氫簡锛屼笉杩囧瀹為檯鐨勭瀛﹁繘灞曞嵈娌℃湁浜х敓浠讳綍褰卞搷锛屽彧涓嶈繃缁欑瀛︾晫鐣欎笅涓€涓瑧璋堢殑璧勬枡鑰屽凡銆�

鍦ㄦ竻鍗庡ぇ瀛﹀巻鍙蹭笂娴佷紶鐫€姊佸惎瓒呭悜鏍¢暱鏇逛簯绁ヤ妇鑽愰檲瀵呮仾鐨勪匠璇濄€傛浌闂細鈥滈檲瀵呮仾鏄摢鍥藉崥澹紵鈥濇绛旓細鈥滀粬涓嶆槸鍗氬+锛屼篃涓嶆槸纭曞+銆傗€濇浌鍙堥棶锛氣€滀粬鏈夋病鏈夎憲浣滐紵鈥濇绛旓細鈥滀篃娌℃湁銆傗€濇浌璇达細鈥滄棦涓嶆槸鍗氬+锛屽張娌℃湁钁椾綔锛岃繖灏遍毦浜嗭紒鈥濇澶ф€掞細鈥滄垜姊佹煇涔熸病鏈夊崥澹浣嶏紝钁椾綔绠楁槸绛夎韩浜嗭紝浣嗘€诲叡杩樹笉濡傞檲鍏堢敓瀵ュ鏁扮櫨瀛楁湁浠峰€硷紒鈥濆湪鐜颁粖鐨勭鐞嗕笅锛屾亹鎬曞儚闄堝瘏鎭繖鏍风殑澶у笀锛屽湪绗竴杞氨瑕佽娣樻卑锛岃€屽挨鍒┞稵路鏂壒鎷夌澶垯浼氭垚涓烘垜浠涔犵殑姒滄牱骞惰幏寰楁暟浠ョ櫨涓囥€佸崈涓囪鐨勭爺绌剁粡璐光€︹€�

鍙傝:http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=220195
IP: 58.31.64.*   | 璧� 璧� +1 [6]鏋楀垰   2009-1-21 19:57
绉戝瑕佸疄鐜版皯闂磋嚜娌汇€�
IP: 159.226.118.*   | 璧� 璧� +1 [5]浣曞+鍒�   2009-1-21 11:09
涔︿腑鑷湁榛勯噾灞�,浣嗕功涔熻閽变拱鐨�
涔︿腑鑷湁棰滃鐜�,浣嗕功涓嶈兘浣滆€佸﹩鐨�
涓嶇煡閬撻檲澶у笀鍦�38宀佸幓娓呭崕浣滃甯堝墠鏄浣曠敓娲荤殑?
濡傛灉娌℃湁鐢熸椿鐨勫帇鍔�,鎴戜滑閮借兘浜彈鏃犲咖鏃犺檻璇讳功鐨勫揩涔�
IP: 12.51.192.*   | 璧� 璧� +1 [4]鏇硅仾   2009-1-21 03:13
涓嶈鑰佹嬁闄堟煇浜哄拰閽辨煇浜轰綔涓轰緥瀛愶紝鍚﹀垯瀛︾晫灏变贡浜嗐€�
IP: 130.149.118.*   | 璧� 璧� +1 [3]鍒樼珛   2009-1-20 18:30
杩欎箞璇达細鐪嬶紝浜哄闄堝瘏鎭紝瀛︿綅閮芥病鏈変竴涓紝閮藉綋娓呭崕澶у鏁欐巿锛屽洓澶у甯堜箣涓€锛涘啀鐪嬩汉瀹堕挶绌嗭紝涔熸槸娌℃湁瀛︿綅锛屽綋鍖楀ぇ鏁欐巿銆�

棰嗗璇达細浣犱滑鍛€锛岄兘鏈夊崥澹浣嶏紝搴旇闄堟煇浜哄拰閽辨煇浜猴紝寮哄惂锛�
鍗氫富鍥炲锛氬垬鑰佸笀璇村緱鏋佹槸锛佷笘閬撳ぇ涓嶅悓鍟婏紒
IP: 210.41.108.*   | 璧� 璧� +1 [2]鏉庡皬鏂�   2009-1-20 17:22
鎺ㄨ崘浜嗭紝浣嗕笉鍚屾剰鍗氫富鐨勪笁鐐瑰彂鎸ャ€�
IP: 222.241.75.*   | 璧� 璧� +1 [1]鍒樿繘骞�   2009-1-20 12:16
娴簛鐨勫勾浠�, 鎬ュ姛杩戝埄鐨勫勾浠�, 寰堝揩瑕佹斂缁╀笌鐮旂哗鐨勫勾浠�.
鍗氫富鍥炲锛欱OBBY鎬荤粨鐨勫お濂戒簡銆�

1/1 | 鎬昏:7 | 棣栭〉 | 涓婁竴椤� | 涓嬩竴椤� | 鏈〉 | 璺宠浆

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2025-2-2 04:39

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007-2025 中国科学报社

返回顶部