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漫话基因组编辑 精选

已有 5204 次阅读 2013-4-2 05:28 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦| DNA编辑, ZFNs, TALENs

最近生物技术领域最火的基因组/DNA编辑技术是肿么一回事?

 

    如何在word文档里进行替换一段文字的编辑?我们常常这样做:用鼠标选中想要替换的文字,然后按后退键或者Delete键删除,再然后把已经复制的一段文字直接粘贴过来,或者直接输入文字。不用几秒钟,编辑完成。仔细分析这个过程,关键的步骤其实就是:选中,删除,替换。

        自然用DNA书写自己的作品。有时候,自然对自己的作品也不满意了,要怎样修改呢?比如,由于环境的改变,携带不同DNA序列的个体面临严峻的生存挑战,那些含有不适应环境DNA的个体就会被淘汰,相当于被选中和删除;那些含有适应环境的DNA的个体则幸存下来,并且替换那些含有不利DNA的个体。其实还是选中,删除,替换的过程。因为这个过程针对携带DNA的生命体,所以要经年累月才能完成DNA的编辑,因此大自然是最耐心的艺术家。

        人类可没有那么有耐性,一万年太久,只争朝夕,哪有时间等大自然的慢工细活呢?所以人工的DNA编辑技术应运而生。目前有三种DNA编辑技术:锌指蛋白技术(ZFNs),转录激活子样的核酸酶技术(TALENs)和基于CRISPR/Cas的编辑技术。这三种技术如何实现选中,删除和替换呢?

        先说选中。锌指蛋白利用人工设计的锌指结构域来识别特异的DNA序列。因为锌指蛋白是哺乳动物中一种非常丰富多彩的蛋白,有广泛的识别序列,因此通过设计锌指蛋白,可以选中基因组数亿碱基中的任何一段。TALENs是用一种不同于锌指蛋白的DNA结合蛋白来识别基因组序列的。CRISPR/Cas则直接用和目标DNA序列相似的RNA来靶定基因组序列。因为用RNA来识别DNACRISPR/Cas同锌指蛋白和TALENs技术这些用蛋白质识别DNA技术相比,在设计上更简单。

        再说删除。锌指蛋白和TALENs都是用限制性核酸内切酶FokI来切掉目标DNACRISPR/Cas则用Cas蛋白降解DNA

        最后是替换。这个很简单,细胞中的DNA损伤修复系统有自动修复DNA的倾向,会自动寻找和损伤部位序列相似的DNA,进行修复。所以只要在删除DNA的同时,加上一段相似的供体DNA(在这供体DNA上你可以做任何想做的手脚,比如换几个碱基神马的),细胞立马就把这个经过修改的DNA换上了。

Word

自然

ZFNs

TALENs

CRISPR/Cas9

选中

环境变化

锌指蛋白

DNA结合结构域

RNA

删除

劣汰

FokI

FokI

Cas9

替换

优胜

DNA供体

DNA供体

DNA供体

千百万年

几周

几周

几周

 

        大自然要千百万年才能完成的工作,现在人们能在几周之内完成,从这个角度讲,只能用一个词来形容基因组编辑:巧夺天工。

参考:图片来自网络,其它参考wikipedia。



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