我使用的linux发兴版本是Ubuntu12.04，如何安装可以看见我的另一篇文。

http://blog.sina.com.cn/s/blog_c260b8350101dw2l.html

下面正式开始安装GMT。

GMT 4.5.9于2013年1月1日正式发布，这个版本依然主要只是bug修订，值得关注的一点在于海岸线数据已经从原来的GSHHS变成了现在的GSHHG。

下载安装所需要的三个文件，放在任意文件夹下

gmt-4.5.9.tar.bz2      

gshhg-gmt-nc3-2.2.3.tar.gz       (http://gmt.soest.hawaii.edu/，在mirror下选择日本的一个镜像)
netcdf-3.6.3.tar.gz        (http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/netcdf-3_6_3/index.jsp)

注：下载时会有gshhg-gmt-nc3-2.2.2.tar.gz和gshhg-gmt-nc4-2.2.2.tar.gz两个文件，其分别对应netcdf3和netcdf4，根据自己要安装的netcdf版本确定gshhg版本。

①安装netcdf

tar -zxvf netcdf-3.6.3.tar.gz                           //解压netcdf
cd netcdf-3.6.3                                         //进入netcdf文件夹

chmod +x configure             //给configure  文件添加执行属性，注意chmod改变文件权限是有限制的，它只能在linux分区下生效
./configure --prefix=/opt/netcdf-3.6.3                  //configure, prefix指定netcdf的安装路径
make                                                    //编译netcdf
sudo make install                                       //安装netcdf

② 安装GMT

cd ..                                                        //退回到netcdf上级目录
tar -jxvf gmt-4.5.9.tar.bz2                                  //解压GMT
cd GMT4.5.9                                                  //进入GMT文件夹
./configure --prefix=/opt/GMT4.5.9 --enable-netcdf=/opt/netcdf-3.6.3/
                                                            //配置GMT。prefix为GMT安装路径，

                                                            --enable-netcdf为前面netcdf的安装路径
make gmt                                                     //编译GMT自己的可执行文件及库文件
make suppl                                                   //编译其他人提供的GMT扩展包及库文件
sudo make install-gmt                                        //安装GMT自己的可执行文件
sudo make install-suppl                                      //安装GMT扩展包
sudo make install-data                                       //安装GMT数据，其实就是拷贝share目录
sudo make install-man                                        //其实是拷贝man到share
sudo make install-doc                                        //其实是拷贝doc到share

③  安装GMT所需要的海岸线数据

cd ..                                                       //返回GMT上级目录

tar -jxvf gshhg-gmt-nc3-2.2.3.tar.bz2                       //解压GMT需要的海岸线数据
sudo cp -r gshhg-gmt-nc3-2.2.3 /opt/GMT4.5.9/share/coast         //拷贝数据，将所有文件拷贝到share下的

                                                              coast目录中

④ 修改环境变量

export PATH=/opt/GMT4.5.9/bin:$PATH

export MANPATH=/opt/GMT4.5.9/man:$MANPATH

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/GMT4.5.9/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export NETCDFHOME=/opt/netcdf-3.6.3

注意：

1、安装和使用最好都是在root身份下进行，Ubuntu默认的隐藏root。具体root登入的方法请参见另一篇博文。实在不会root身份登入，也可以直接打开终端（快捷键 Ctrl+Alt+T）输入：su root；然后按照要求输入密码；

以上就完成了GMT的安装，但是有一个问题我还没有解决，就是每次重新打开终端都需要再次执行第四步的修改环境变量，不然就不能使用GMT。这是需要解决的大问题，还在初学阶段。

修改（2014.2.23）：上面问题的解决办法如下，如果是一般用户就在你的根目录（/home/chaoshu下），如果已经在root身份下登入就在root文件夹下（/root）查看-->显示隐藏文件，打开一个系统启动文件.bashrc修改环境配置变量（其实就是把第四步写到该文件下，然后重启就可以了。）

2、安装的ubuntu系统中安装netcdf时在make的过程中可能会出现一些错误并退出，这个并不影响make install，其实主要是不影响GMT的安装和使用。（我安装时出现了这个问题）

报错为：

gcc: error trying to exec 'cc1plus': execvp: 没有那个文件或目录

make[2]: *** [netcdf.lo] 错误 1

原因：未安装g++

解决办法：

sudo apt-get install g++

注意：可能需要保证gcc和g++的版本一致性

安装之后重新make就好