药物分布至作用部位，必须透过不同的屏障，如毛细血管壁、血脑屏障、胎盘等。对于毛细血管壁，脂溶性或水溶性小分子易于透过；非脂溶性药物透过的速度与其分子大小成反比（大分子药物如右旋糖酐，通过毛细血管很慢，停留在血液中的时间较长，故可作为血浆代用品）；解离型药物较难透过。对于血脑屏障，水溶性化合物难以通过，脂溶性物质如乙醚、氯仿等则易于通过。青霉素不易通过血脑屏障，进入脑脊髓液的比率很小，故用它治疗流脑时，必须加大剂量，才能保证脑脊液中有足够的浓度。对于胎盘，非解离型的高脂溶性药物，例如某些全身麻醉药、巴比妥类，易于通过，而高度离解或脂溶性低的药物，如季铵类、右旋糖酐，透过率则很低。孕妇用药时，必须考虑药物会不会通过胎盘进入胎儿体内而造成不良后果。

   血脑屏障是指血浆与脑细胞或脑脊液间由特殊细胞构成的屏障，这是大脑自我保护机制。药物只有通过血脑屏障才能进入脑组织，此屏障能阻止某些大分子、水溶性和解离性药物通过；脂溶性药物可以通过。当脑膜有炎症时，血脑屏障的通透性增加，使某些药物易进入脑脊液中。如青霉素一般难以进入脑脊液，但在脑膜炎患者的脑脊液中可达有效浓度。

　　胎盘屏障是由胎盘将母体与胎儿血液隔开的屏障，其通透性与一般细胞相似，脂溶性高的药物易通过，解离度高的药物则难通过。有些药物对胎儿有毒性或者易导致畸形，故孕妇用药应慎重