网页版Phylomatic能够通过物种名录构建谱系树，这使得在生态学研究中结合物种谱系信息不再遥远。

    Phylomatic（Version 3）相对于2009年上线的旧版其主要改进在于后台数据库。新版的后台数据库综合了最新的植物系统学研究成果，覆盖范围从被子植物延伸至裸子植物和蕨类植物，并能根据用户在新版界面上提交的系统学研究成果实时更新。用户提交的物种名录后网页程序自动完成与后台数据库的匹配，给出谱系树。后台数据库的改进使用户得到的谱系树更加准确可靠。

 使用方法：

1、选择storedtree，如Phylomatic treeR20120829(plants)

2、method= phylomatic    

3、粘贴物种名录，如

rosaceae/spiraea/Spiraea_salicifolia
ericaceae/vaccinium/Vaccinium_uliginosum
ericaceae/vaccinium/Vaccinium_vitis-idaea
caprifoliaceae/lonicera/Lonicera_maackii
rosaceae/rosa/Rosa_davurica
rosaceae/potentilla/Potentilla_fruticosa
salicaceae/salix/Salix_siuzevii

……

4、选择taxaformat、clean 和 outformat。 

注：不勾选clean时，输出结果保留较多可供匹配的节点，phylocom baldj输出的枝长结果较可靠；勾选clean, phylocom bladj 枝长准确性降低，但不存在 single node，易读取。

5、Send

 

对于科属不能匹配的情况，可在Agiosperm Phylogeny Web 网站点Family 查询  http://www.mobot.org/MOBOT/research/APweb/，修改后重新上传。

好啦，把输出的结果保存到文本文件，用treeview打开看看吧。