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复杂网络分析的矩阵格式:以Pajek的.mat格式为例。

已有 16206 次阅读 2012-12-22 19:21 |个人分类:网络分析|系统分类:科研笔记| 矩阵, 复杂网络, 网络分析, Pajek

网络分析软件Pajek的.mat格式
在数据分析时,矩阵是最常见的数据存储格式之一。在矩阵的行和列相交的格子中,可以保存行和列之间的关系,例如第m行第n列相交的格子中,表示的是第m个顶点与第n个顶点的关系。这通常要求矩阵是一个正方形。
例如:

*Vertices 10

1 "AAA"

2 "BBB"

3 "CCC"

4 "UUU"

5 "WWW"

6 "ZZZ"

7 "YYY"

8 "XXX"

9 "VVV"

10 "DDD"

*Matrix

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.900 2.100 1.300 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000 0.000 0.000 3.600 0.000

0.000 6.500 0.000 1.100 2.300 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 4.200

7.200 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

(第1行第1列是0.000,表示没有从顶点1发出指向顶点1自身的连线)
(第1行第6列为1.900,表示从1号顶点AAA指向6号ZZZ的权重为1.9的箭头)
值得注意的是:Pajek默认所有矩阵格式的网络文件都表示的是有向图,也就是说,都是从行指向列的弧。如果做的是无向图,那么在Pajek读取后,先把它从有向图转换成无向图,然后再保存为Pajek Arcs/Edges(.net)格式。
请注意,各个数据之间是以空格分隔,而不能是制表符分隔。


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