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生物信息学相关网站

已有 7348 次阅读 2012-9-19 16:31 |系统分类:科普集锦| 信息学, 网站, 生物

生物信息学与生物计算http://bioinformatics.weizmann.ac.il/
     这是生物信息学和生物计算学的网站,由Weizmann科学研究所,生物服务部和Crown人类基因组学中心支持。研究领域主要涵盖序列分析,蛋白质组学和基因组学等。该网站提供了数据库,电子论坛,教育,新闻,软件,招聘启事等。该网站还提供了相关链接,包括欧洲分子生物学以色列国家网点,以色列国家基因组基础设施实验室以及国际生物信息学合作中心。

生物信息学专题http://www.biosino.org/bioinformatics/bioinfo.htm
     中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心的网站中的生物信息学专题提供与生物信息学有关的新闻信息,生物信息学文献的介绍(包括的课题例如:鉴别肿瘤的亚型,细菌中的基因转移,生物钟与微阵列--哺乳动物的基因组有节奏,混乱的DNA区分人类与黑猩猩等等),相关软件下载,与数据库的链接。

生物信息学专业网http://bioinf.bmi.ac.cn/
     生物信息学专业网旨在收集、整理与生物信息学相关的信息和资源。它的站点提供最近新闻;与生物科学相关的论文;与生物信息学相关的数据库,软件,公司,大学和期刊;工具的介绍,例如:序列逆向查询系统。

生物信息学组织http://bioinformatics.org/
     生物信息学组织是生物信息学学科的综合性网站。其涉及的内容有新闻、事件提醒、会议消息、免费FTP工具下载、论文、URL推荐、演示幻灯片等。此外,其还拥有有关生物信息学研究组和软件的搜索引擎。

香港生物信息学中心http://www.hkbic.bch.cuhk.edu.hk/
      这是香港生物信息学中心(HKBIC)的网站。香港生物信息学中心是由香港技术创新委员会和香港中文大学创办,为香港生物技术与工业界提供中心数据资源。它为使用者提供计算设备,技术专家意见和分子生物学定向数据库等。主要致力于核苷酸、医学、药物设计、毒理学、生物技术、化学工程、制药技术等方面的研究。该网站还提供了研究、工具、新闻等方面的。

耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室http://bioinfo.mbb.yale.edu/
      这是耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室的网站。耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室主要致力于生物信息学的研究,其研究领域包括基因组序列,大分子结构和表达基因数据,比较基因组学,基因表达分析,大分子几何学等。该网站还提供研究、工作、演讲、论文等方面的信息。

用于比较基因组学的生物信息学工具http://pga.lbl.gov/Workshop/webTools.html
      用于比较基因组学的生物信息学工具是劳伦斯伯克利国家实验室提供的用于比较基因组学的生物信息学的软件、数据库和网址资源。其涵盖五个大类分别是:基因组数据、注释、比较基因组、阵列资源、杂集。并且,对每个类别其都有类型、名称和描述、帮助及信息等方面的说明。

中国生物信息学资源导航http://www.biosino.org/pages/source-bioinfo.htm
      这是中国生物信息学资源导航的网站。该网站主要提供与生物信息学相关的学会、组织和生物计算中心的链接,也包含对网关及网络资源的链接。

生物信息学探讨www.seq.cn

     这是生物信息学领域的专家、学者交流讨论的平台。由中国科学院计算研究所生物信息学小组进行精心的维护工作。

NCBI生物信息学研究工具http://www.ncbi.nih.gov/Tools/
      NCBI生物信息学研究工具网站由美国国家生物技术信息中心支持。该网站提供了许多程序的链接,内容包括数据挖掘、核酸和蛋白质组分析等。同时,网站还提供了许多相关链接和资源。

欧洲生物信息学研究所http://www.ebi.ac.uk/
      欧洲生物信息学研究所是一个非盈利学术机构,是欧洲分子生物学实验室的一部分。它是生物信息学研究和服务的中心。它所管理生物数据的数据库包括核酸,蛋白质序列和大分子结构。它的使命是保证从分子生物学和基因组研究的日益增长的信息向公众公开,并且对科学研究团体提供任何方面的免费使用,以促进科学发展。

欧洲生物信息学研究所Ensembl基因组浏览器http://www.ebi.ac.uk/ensembl/index.html

欧洲生物信息学研究所Thornton研究组http://www.ebi.ac.uk/Thornton/index.html

欧洲生物信息学研究所多序列联配数据库: http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/alignment.html

欧洲生物信息学研究所工具箱:http://www.ebi.ac.uk/Tools/

欧洲生物信息学研究所核酸数据库:http://www.ebi.ac.uk/Databases/nucleotide.html

欧洲生物信息学研究所计算基因组研究组:http://www.ebi.ac.uk/research/CGG/index.html

欧洲生物信息学研究所完整基因组数据库:http://www.ebi.ac.uk/genomes/

欧洲生物信息学研究所序列数据库研究组:http://www.ebi.ac.uk/seqdb/index.html

Brutlag生物信息学研究组http://motif.stanford.edu/
     Brutlag生物信息学研究组是斯坦福大学的一个研究团体,主要研究从蛋白质一级结构预测蛋白质结构和功能,其开发了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF软件应用于非鉴定的基因组序列的功能确定,另外还开发了LOCK和3DSEARCH软件用于比较蛋白质结构和蛋白质结构数据库的搜索。

生物GBF信息学小组主页http://transfac.gbf.de/
      生物信息学小组主页是德国生物技术研究中心的生物信息组的主页。其提供的资源十分丰富,包括出版物、研究计划、研究组介绍、五个重要数据库、十二个工具软件和资源链接等。

Pune大学生物信息学中心http://bioinfo.ernet.in/
     Pune大学生物信息学中心成立于1987年,是生物技术系统的九大中心之一。提供生物工程领域的信息,侧重病毒学,蛋白质和核酸序列与结构。其提供的资源丰富,包括数据库、微生物菌株数据网络系统、生物信息学中心图书馆、Alpha服务器的软件包、生物信息学的有用网址、EBI和PDB的数据库镜像等。

北京大学生物信息学中心http://www.cbi.pku.edu.cn/
     北京大学生物信息中心(CBI)成立于1997年,是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家接点。几年来,已经与多个国家的生物信息中心建立了合作关系。目前是国内数据库种类最多,数据量最大的生物信息站点。在基因预测、基因组、蛋白质结构等领域都有相应的研究项目。

加拿大生物信息学资源http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/index_e.php
     这是加拿大生物信息学资源(CBR)的网站。该网站由加拿大国家研究委员会(NRC)创建,旨在为国家研究委员会与其它政府、学术部门的科学家提供广泛使用的生物信息学工具和共享数据。加拿大生物信息学资源部分由一个专门使用该资源的委员会管理,而且其资源在用于教育和非盈利研究时只需注册均可免费作用。网站还提供有关新闻、服务与下载等信息。

结构生物信息学公司http://www.strubix.com/
     结构生物信息学公司是世界上占领导地位的、蛋白质组学推动的药物发现的公司,他们大规模地产生和使用蛋白质结构信息,以期加速发现和优化过程。它提供的软件主要针对加速药物发现和优化过程、提高筛选效率和降低成本、极大地重视知识产权的地位、提高药物性能和增加技术和市场成功的可能性。此外,还提供三个药物数据库。

林奈斯生物信息学中心http://www.lcb.uu.se/
     这是林奈斯生物信息学中心(LCB)的网站。林奈斯生物信息学中心研究非常活跃,隶属于瑞典Uppsala生物医学中心。作为一个由Uppsala大学与瑞典农业大学的联合研究机构,确保了高质量的尖端的研究与教育,其研究范围从微生物与哺乳动物基因组学经计算机的功能基因组学到分子进化。网站还提供有关入学、新闻时事、研讨会、工具、学生计划等方面的信息。

曼彻斯特大学生物信息学教育与研究http://www.bioinf.man.ac.uk/
     曼彻斯特大学生物信息学教育与研究是欧洲分子生物网络的节点之一,负责维护一些数据库(如蛋白质模体指纹数据库,PRINTS)。站点提供蛋白质同源性分析,蛋白质模体指纹分析,系统发生和序列进化分析,以及微阵列分析,并提供生物信息学和PRINTS数据库数据下载。

《生物信息学》:http://www3.oup.co.uk/jnls/list/bioinformatics/etoc.html
     《生物信息学》是由英国牛津大学出版社出版。其主要刊登生物信息和计算生物学方面的研究论文、书评、综述、读者来信和述评等文章。其刊载的文章在两年内供给学术界免费使用。

生物信息学http://biotech.icmb.utexas.edu/pages/bioinfo.html
     生物信息学是印第安纳大学分子和细胞生物学研究所提供的生物信息学资源。此资源包括数据库、基因发现程序、蛋白质模建、生物信息学在线教程、研究基金的来源、研究项目和生物信息学工具软件等。

生物信息学的网络资源http://www1.cs.columbia.edu/~cleslie/cs4761/resources.html
     生物信息学的网络资源是美国哥伦比亚大学的Bill Noble教授建立的有关生物信息学的网络资源总集。其涉及面广,包括基因组学和生物信息学中心、生物信息学工具和基因组计划索引、DNA和蛋白质分析工具、生物信息学课程主页、生物信息学和生物技术的学术项目、生物信息学文献参考,以及网上引物。

生物信息学趋势导向http://www.ped.med.utah.edu/genpedscrr/Trends.htm
     生物信息学趋势导向主要提供《今天免疫学》杂志的增刊有关生物信息学的内容。这些内容包括的资源十分丰富,涉及文本格式数据库,原理和实用数据库搜索,计算生物学基因发现,多序列联配和检索,蛋白质分类和功能归属,系统进化分析和比较基因组学,功能基因组学等。

生物信息学网http://starr2.myetang.com/
     这是生物信息学的网站,主要是负责中国医学科学院肿瘤医院/肿瘤研究所生物信息学研发及服务工作。该网站提供生物统计分析以SAS和R为主,并且设有其他数十种生物信息学分析辅助软件,如Blast,Phrap, Bioperl, EMBOSS, Hmmer, GO等等。另外也提供论坛,相关论文以及常用生物信息学网址等。

生物信息学小组http://life.anu.edu.au/
     生物信息学小组成立于1997年,主要从事分子生物信息学和生物多样性信息学的研究。其提供丰富的软件资源,可免费下载使用。软件种类涉及重组扫描、系统发生分析、联配、重复片段的检测和PCR引物设计等。此外,还有许多数据库资源。



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