梁先庭

 拿文章千古说事，抒发寸心得失情怀，大多有自恋之谦。古已有之，至今不绝。然而，踌躇再三，找不到更确切的字眼来描述我此刻的心情。算是嚼一次别人啃过的馒头吧。

 关于光合作用能量传输相干性的论文（arXiv:0809.0039），是07年暑假开始考虑的。先做了一个初步的模型，不久便做出了结果。我们建立了一种光合作用细菌色素（Rhodobacter sphaeroides）中能量从色团Bchl到色团Bphy传输的动力学模型，研究了两个色团激发态相干叠加的退相干时间。数值模拟与Fleming小组发表在Science 316,1462 (2007)上的实验结果进行了比较，发现两者吻合。初步的结果让我们非常兴奋。期间，应邀去日本的茨城大学与国内相关高校做了介绍。

 由于这是一个我等并不熟悉的新领域，而实验文章即涉及光生物学背景又有许多激光光谱的解读知识，因此一直没有付与成文。08年花了整个暑假的时间学习 Mukamel教授的有关激光非线性光谱方面的专著[Principles of Nonlinear Optics and Spectroscopy, New York: Oxford University Press (1995)]，并反复阅读、推敲Fleming小组的相关论文，然后将研究所得写成了一个论文初稿。从此便与两位合作者进行频繁的Email交流与讨论。模拟没有问题，关键是物理模型还不十分清楚与可靠。这样，便带着问题，于08年9月7日开始去台湾成功大学与为民讨论，并不时与益忠教授Email交换看法。

 在初稿的基础上对物理模型做了认真的修改。到08年12月10日我们基本完成了一个相对成熟的稿子，投寄PRL。09年1月29日，从台南回到宁波的第22天，收到PRL转来的两个审稿人的审稿意见。审稿人1对文章给出了很好的评价并给出了修改意见，审稿人2做了负面评价，但推荐在JCP发表，而PRL编辑部同意我们修改重投。

 4月12日，我们在经过大量的讨论与修改后将第二稿重投PRL，5月28日收到二审意见，被PRL拒了。其间变换了多位审稿人。我是觉得审稿人没有真正说服我的。但是我知道，要毙你，不见得非要给出怎么符合逻辑的意见，个中辛酸不说了。

 09年6月12日我们在PRL二审意见的基础上对文章又做了一些修改，变换了格式改投PRE。PRE并没有考虑PRL审稿人1的“同意接收”的意见，又送了两位审稿人。这次又出现了两位审稿人的意见相左的情况。审稿人3给予了高度评价，同意接收发表，审稿人4又提了一大堆的意见，做了负面评价。

由于两位合作者的耐心，我们又按照第四个审稿人的意见修改，重投。8月份收到PRE的二审意见。非常意外的是，其中至少又增加了一位审稿人，两位审稿人又提了一大堆的问题，并要求对文章的结构做大幅度的调整，增加大量的计算。而关键是，他们仍然对模型不放心。我已经失去了耐心，几乎要疯掉了，写了一封措辞不很友好的Email，准备发给编辑部。幸亏冷静下来了，这封信没有发出。

我们看到，前后几位审稿人与PRE编辑在回复意见中大都肯定了文章研究内容的重要性。据我所知，PRE给予两次以上修改的机会也是不多见的。而审稿人的意见主要集中在所导出的物理模型的理解上。我们导出的模型是一个能量差与耦合项都含时的Spin-boson模型，目前还没有相关文章对此做同样的处理。于是，为了把模型的物理背景与实验设计理解得更清楚，借北京出差的机会，到中科院化学所飞秒激光实验室进行了学习与交流，有幸与我国飞秒激光化学方面的专家，化学所所孔繁敖先生等同仁进行多次交流，物理模型越来越清晰。最后在两位合作者，特别是为民教授的共同努力下，于09年11月19日完成PRE的第二次修改，重投PRE。2009年12月22日收到PRE编辑部意见，审稿人非常满意我们做的修改与对问题的回答。PRE做出决定，同意接收发表。至此距第一次投稿已过了一年又12天。

一个有意思的细节是，审稿人4最后置疑我们选择的耦合项的取值210cm^(-1)，并要求我们发信给Fleming教授获得真实的耦合量。我在很不情愿的情况下，由于合作者的敦促，向Fleming教授求援，他的学生Lee从飞秒激光器生产厂方获得了激光场强的参数，并热情地告诉了我有关的数据。按照审稿人提供的文献，我们计算获得的耦合量为209cm^(-1)。与起初我们的选择非常接近。这样，我们更加坚定了对所取模型的信心，也许正因为这才彻底说服了审稿人。

这是一次非常艰难的尝试，对于我来说也是一个重要的收获。从合作者那里学到了很多，特别是两位先生对物理异常清晰的理解使我受益良多。同时，得到了除Fleming教授小组以外的Plenio（imperial，uk）, Chandrashekar（iqc，ca）, Briegel（uibk，at）, and Strauch（williams）多位国外专家的关注。除了在台湾与张为民教授讨论4个月外，我与张教授就本论文Email讨论共163次，数值模拟至少进行了500次，耗费了大约480个机时。

本文说明了两个色团激发态相干叠加态的退相干时间可以达到400飞秒，这个时间为光合作用系统能量的相干传输提供了可能。然而，能量的相干传输是否确实提高能量的传输效率，实验上与理论上都还没有直接证据，我最近的一个工作从理论上给出了肯定的答复。不久将会将这一结果上传arXiv.org网站。

2009-12-31 于宁波大学龙赛理科楼